道雲閉上眼睛，光芒籠罩下來，他消失在了別墅頂層的房間內。
這部電影的故事背景發生在未來，2013年，太平洋深處出現一個稱爲‘突破點’的平行宇宙傳送門，爲一大羣外星巨獸怪獸展開一條侵略的道路。
值得一提的是，這是一部由多個國家共同參與執導的電影，而其中作爲奧特曼和怪獸的發源地，東瀛的怪獸文化已經深深進入全球人民的心，所以這所謂怪獸也是用的他們的語言翻譯，直接稱作kaiju。
接二連三的怪獸襲擊造成人類傷亡和損失慘重，世界各國合作研發出能夠和怪獸抗衡的武器機甲：獵人。
作爲能夠對抗怪獸的巨大機器人，需要由兩名腦部神經網路互相串連（浮動神經元連結）的操縱者同步操作。最早的時候是由一人操作，後來發現根本無法控制機甲，便改良爲雙人操作模式。
靠着機甲獵人，人類開始抗擊怪獸勢力，爲怪獸戰役拉開序幕。
2020年，美國機甲‘吉普賽危機’負責攔截一隻即將登陸阿拉斯加的怪獸鬼刀頭時，駕駛員萊利和彥西·貝克特兄弟二人爲了救一艘漁船，導致機甲嚴重損毀，目睹彥西陣亡的萊利單獨作戰並最終獲勝。
回到海灘上獲救後，在浮動神經元連結中感受過一次死亡的萊利決定放棄保家衛國的使命，留在海灣一帶當建築工人爲生。
五年後，各國機甲獵人相繼敗陣，總指揮官史塔克·潘特考斯得知政府將不再資助他後，將各國僅存的四架機甲獵人：中國‘暴風赤紅’、俄羅斯‘車諾阿爾法’、澳州‘衝鋒發現號’以及修復升級完成的‘吉普賽危機’集體聚集至位於香港的基地，計劃靠放置核彈來徹底摧毀突破點。
史塔克還找回如今當建築工人的萊利，在測試萊利的副駕駛候選人時，萊利看中史塔克身邊的日裔工程師森真子，和精通武藝的她對打平手後認定她是人選。
但在吉普賽危機試運行當天，萊利和真子首次通感時，雙方都因爲受到失去家人的過去陰影影響而分心，而真子也因爲陷入她童年時失去父母、被怪獸追逐的回憶中無法自拔而險些釀成大錯。
衝鋒號駕駛查克·韓森因此斥責他們，但萊利也在真子的回憶中得知史塔克於數年前在東京救過她。
基地中的怪獸科學家紐頓·蓋茲勒用一塊摘取下來的怪獸大腦樣本，進行史上第一次人獸通感實驗，實際上黑市商人漢尼拔·周早就進行過一次與怪獸通感了，只是沒有被曝出來而已。
而在實驗成功下，紐頓得知近幾年出現的怪獸都是隻是一羣複製的‘清道夫’，真正族羣‘怪獸先驅’則在另一邊等待消滅完人類後霸佔地球，用盡所有自然資源後再移居別處。
史塔克爲了確認信息而命令他重新進行實驗，提議他去找怪獸黑市商人漢克尼拔·周得到樣本，並表明他目前的資金都是漢克尼拔贊助。
這時，兩隻強大怪獸‘鐵尾’與‘革龜’全速向香港前進，史塔克下令暴風赤紅與車諾阿爾法前去攔截，衝鋒發現號待命作爲支援。
紐頓來到香港市中心找到漢克尼拔·周的店，對他表示來此目的時，漢克尼拔推斷兩隻怪獸同時出現是因爲羣體智慧追蹤到紐頓的通感而將他趕出去，紐頓便藏身到城市地下的公共避難所。
所幸的是，由萊利與真子操縱的吉普賽危機靠核供電歸來，一雪前恥般的將兩隻怪獸全部消滅，讓他們倆重獲所有人的支持與歡呼。
史塔克在過來表示支持時開始流鼻血，於是對萊利供述他十年前在東京獨自操縱機甲時救下真子的當天，長達三小時的過程而造成他身體長期輻射中毒。
當另外兩隻四級怪獸‘雷獸’與‘惡混’爬出並按兵不動地對突破點口進行看守時，史塔克決定代替因爲手受傷的查克的父親赫克，冒着生命危險而親自陪查克移送核彈。
漢克尼拔的開採團隊在第一時間來到鐵尾的屍骸中搜刮，進入屍體中時發現鐵尾的大腦早已在戰鬥中嚴重受損。
然而，紐頓靠裏面的微弱心跳聲來得知鐵尾肚中懷孕一隻小怪獸，小怪獸瞬間從肚子裏爬出，將站在原地的漢克尼拔吞食後，最終被未割斷的臍帶勒死。
紐頓因此幸運獲得一個完整的大腦，赫曼跑來和他會合後，決定一起利用小怪獸大腦進行通感。
不久，兩架機甲獵人來到深海突破點邊緣準備進行核彈投放工作時，紐頓與赫曼跑來通知說突破點的規律是根據怪獸身上的基因去判斷物體，而核彈與機甲獵人因爲沒有攜帶任何怪獸基因而無法通過。
所有人茫然無措之下，史上第一隻第五量級怪獸‘毒婦’從突破點爬出，兩架機甲由於在水中無法使用陸上武器，受到三隻怪獸的聯合攻擊下嚴重受損。
走投無路之下，史塔克與查克決定犧牲他們自己來爲萊利和真子開一條路，與衆人告別後引爆核彈，而現場只有毒婦受傷倖存。
萊利與真子衝向毒婦且跳進洞裏後，用胸口的核反應爐將它直接燒死，與其屍體直接成功進入突破點裏。
萊利先將缺氧的真子送入逃生艙離開後，一人與機甲穿越突破點來到另一邊，開啓核反應爐自我溶毀系統後迅速用逃生艙脫離。
突破點隨着機甲溶毀徹底摧毀並封死，使命達成讓所有人歡呼不盡，萊利與真子的逃生艙也浮在海面上，兩人也在救援直升機到達時相擁。
代替史塔克成爲總指揮官的赫克，對衆人高喊突破點已經摧毀，耗時十二年的怪獸戰役也隨之終結。
這便是第一部的劇情，第二部的故事則是發生在第一部十年後，怪獸捲土重來的故事，至於第三部，還沒拍出來，從第二部最後的彩蛋裏可以看出來，第三部就是要打入怪獸老巢了。
環太平洋這個詞，指的是抵禦怪獸的第二計劃，這個計劃在機甲獵人失敗後便被各國列入了首要計劃中。
那就是在太平洋沿岸的地區，建起一座‘生命之牆’來阻攔怪獸的進攻。
這是一個相當諷刺的詞彙，這讓道雲想到了一部動漫，進擊的巨人。人們將自己當做牲口一樣圈養起來，最後被攻破城牆的巨人屠戮殆盡。而這部動漫同樣是東瀛產物。
道雲只能說這個世界的上位者真的是腦洞太大了，又或者他們根本不在乎城牆附近的普通民衆死活，城牆攻破一次修復一次，長此以往，內圍的他們就不會有危險。