在原著中，西迪厄斯成功顛覆了銀河共和國之後，就結束了自己一手挑起的反叛。
派新徒弟達斯·維德出馬，把貿易聯盟的領導者紐特·岡雷和盧恩·哈寇等人都給殺了，直接結束了叛亂。
如今西迪厄斯沒能夠登基稱帝，他當然不會好心去清除貿易聯盟，這個麻煩肯定要留給共和國政府和絕地武士團來解決。
而反叛勢力，還只是諸多麻煩中的一部分。政府內部也有很多危機需要處理。
西迪厄斯跑了，可他的追隨者依然把持着政府中很多的重要職位。雖然被捉拿了很多，但這個時候還有不少人沒有暴露。
小明確實有能力分辨到底誰是西斯的追隨者。無奈他的精力有限，只能排查首都的一部分高級官員。
科洛桑的低級官員都查不過來，至於首都以外，更加鞭長莫及。
另外，西迪厄斯逃跑後，絕地武士團也不敢太過倚重教主等人。
對於這幾個突然冒出來的強者，就連尤達大師也不敢100%的信任。
儘管他已經比較相信教主了。卻也擔心一旦教主幾人掌握了太多的權力，野心也會隨之膨脹。阿納金就是前車之鑑。
他們當然不知道對於這個世界，教主他們只是一羣過客，隨時都可能捲鋪蓋走人。
不過話又說回來，如果小明想在這個世界混一輩子，輪迴空間也是允許的。
因此尤達大師的擔心，也不全是杞人憂天、空穴來風。確實有發生的可能性。
小明的宅男屬性真的能蓋過統治整個銀河系的誘惑嗎？還真不好說。
不知道尤達大師是蒙對的呢？還是原力真的給了他提示。
絕地武士團用了至少3天的時間，纔算把銀河共和國政府穩定了下來。
超過半數的議會議員被捕，他們所代表的的各個行星，都要經歷一番動盪。這不是絕地武士短期內可以擺平的事情。
剩餘的議員，臨時推舉貝爾·奧加納擔任銀河共和國的臨時議長。
貝爾·奧加納，原銀河議會議員，奧德朗星系總督。克隆人戰爭中的英雄，一個非常有影響力的政治家和忠誠的議員。
他和歐比旺·克諾比、尤達等著名的絕地大師建立了深厚的友誼。帕爾帕廷議長一直都很重視他，也很提防他。
在克隆人戰爭時期，由帕爾帕廷的黨羽積極推動，議會賦予了議長戰爭時期的緊急處置權。
正是因爲有這個權力，西迪厄斯才能直接激活66號命令。否則想要把絕地武士團打成叛逆，必須要議會7成以上的議員同意。
這樣的通過率先不說能不能做到。剛開始籌劃，絕地武士團就會得到消息。根本辦不成事兒。
隨着議會把越來越多的權力交給了議長，敏感的貝爾就察覺到了危機。他開始聯絡一些“正直”的議員，準備對抗。
後來，在西迪厄斯篡位成功以後，他參與組織義軍同盟與銀河帝國對抗。一直都是親絕地陣營的議員。
貝爾議長所做的第一件事情，就是取消66號命令，同時宣佈全銀河系通緝原議長帕爾帕廷，現在的西斯尊主達斯·西迪厄斯。
接着將議會原來賦予議長的各種臨時權力，交還給了議會。
貝爾是否真的有這麼高的覺悟，可以不爲權力所迷惑，也不好下定論。至少暫時他做得還算不錯。
然而，他的命令並沒有得到徹底的執行。因爲他這個臨時議長有點名不正言不順。
議會之中半數以上的議員被捉拿，這種情況下議會是沒有權力的。必須要重新選舉各星系的議員，重新召開議會纔行。
但是目前的情況又是戰爭時期，特事特辦，臨時這麼搞一下，似乎也說得通。這就在克隆人軍團中引起了不同的反應。
因爲有芯片在，克隆人士兵都是忠於銀河共和國的。只是對前後兩個議長的命令，他們的大腦有點宕機了。
還好他們不是機器人，否則cpu都會被燒燬的。他們都從人類的視角出發，作出了自己的選擇。結果克隆人軍團不可避免的分裂成了三個部分。
大約14的人選擇忠於前議長帕爾帕廷；14忠於現議長貝爾；剩餘的決定中立，只維持所在地區的治安工作。
而且這三部分並不是涇渭分明的，基本上你中有我，我中有你，勢力交錯複雜。
當某一方佔據優勢的時候，其他幾派往往會被清理。如果大家差不多的話，那就三足鼎立、各幹各的。輕易不會展開大戰，小規模的摩擦就經常發生了。
從概率學來講，還是以三足鼎立的局勢居多。單獨一方佔據優勢的情況相當少見。
只有在首都，忠於帕爾帕廷的克隆人軍隊佔了大多數。畢竟這些克隆人長期在帕爾帕廷議長的親信領導之下。傾向性很明顯。
例外的是501軍團。這支軍團忠誠於達斯·維德，因爲阿納金最後迴歸絕地武士團一方，501軍團順勢倒向了聖殿。
其他那些經常和絕地大師並肩作戰的克隆人軍團，不少也都倒向了聖殿。
他們應該也算是中立派。沒有服從任何一個議長。不過和貝爾議長派相處得比較和睦。也變相的穩定了各地的局勢。
絕地武士大師，尤其是最高委員會的委員，每個人的個人魅力都是不容小覷的。他們對麾下的克隆人士兵有着很深的影響。
雖然這些大師，大多數都死在克隆人軍團手上。但這些克隆人軍團反而是最先向聖殿靠攏的。
從這一點也能看出，克隆人和自然人的區別。
如果是自然人，面對這種選擇的時候，他們馬上會想到是自己殺害了絕地武士。
擔心被報復被清算，儘管明知道是錯的，他們也會將錯就錯，投靠西迪厄斯。
但克隆人沒有自然人那麼複雜的花花腸子。他們按照心中認爲正確的方向做選擇，不會考慮被報復一類的事情。