但是，經過這次海戰之後，全琮的艦隊即使是取得了大勝，但是卻也有戰艦受到了傷害，需要靠岸交給隨軍通行的造船廠技工進行修復。
何況，新繳獲的四艘海盜船的損傷其實也非常嚴重，必須要趕緊對他們進行修復，否則戰鬥力根本近乎完全喪失。
而且，艦隊從海盜艦隊繳獲了不少貨物，這些東西對於他們而言沒有任何用處，也需要找到地方出手，或者將它們換成需要的各種補給物資才合算，否則白白佔據了艙位實在是一件非常浪費的事情。
全琮接下來將艦隊重新編列隊形之後，對那些在海戰之中陣亡的士卒進行了海葬，然後才指揮艦隊向着婆羅洲而去。
艦隊很快就通過了南沙羣島海域。
但是全琮的艦隊似乎在此次遠洋航行之中，顯得並不十分幸運。他們的艦隊在海上遇到了風暴，艦隊的編隊被完全衝散，戰艦之間也失去了聯繫。網更新最快 電腦端:..
後來經過艦隊的統計，全琮的旗艦威南號因爲噸位巨大，所以損傷並不是很大，只有左舷出現了一些傷害，有些漏水，被船上的士卒進行緊急修復之後安然無恙。
但是其他的戰艦有的就比較不幸，其中三艘戰艦的桅杆被風暴吹斷，兩艘戰艦艦體出現比較嚴重破損，船艙裏面進水非常嚴重。
其他戰艦的狀況，倒是都還好。
另外，還有一百二十個士卒，在此次風暴之中遇難，還有三百多人受傷，急需要趕快治療。
這些狀況其實還不是最爲糟糕的。
最爲糟糕的是，全琮的艦隊在這次風暴之中被衝散。
等到風暴結束之後，威南號周圍海域只剩下了八艘戰艦，以及兩艘補給船，還有少量的警戒船。警戒船上面的船員早就在風暴過來的時候，就及時登到了大型戰艦上面倖免於難，但是不少警戒船都被巨大的海浪衝走或者損毀了。
全琮走上甲板，望着空蕩蕩的海面，大部分的艦船都已經完全不見了蹤影。
全琮心裏非常擔心他們的安全。而且那些補給艦裝滿了艦隊所需要的物資，就是從林邑國帶出來的應急資金和從海盜艦隊搜到的財富，也大部分都放在了它們那裏。如果失去那些物資的話，對全琮的艦隊而言，無異於是一場滅頂之災。
不過，全琮堅信艦隊即使有所損失，但是應該不至於太大。
於是，全琮傳令全體艦船做再次損傷評估後，重新啓動向着原先約定的集合地點婆羅乃以緩慢的速度前進。婆羅乃，也就是今日文萊的古稱burunei的音譯。
它們的速度之所以下降，一方面是因爲所有戰艦都有受損，另外一方面，風暴過後，海上的風向有些變化。
威南號的後面還拖着受損最爲嚴重的先鋒號，速度不得不也跟着放緩了很多。
全琮的艦隊經過了艱苦的八天的海上緩慢航行之後，終於是到達了預定集合地點婆羅乃海灣，然後調轉方向進入西南方向的斯里巴加灣岸上的海濱平原就是今日文萊的首都。
斯里巴加灣是海洋深入陸地而形成的海灣，三面都是陸地，是一處很好的避風港灣。西面所面對的就是婆羅乃河的河口，全琮的艦隊還可以那裏獲得大量的淡水補給。
而且，值得一提的是，在全琮的艦隊向婆羅乃海灣慢速行進的途中，又有八艘戰艦和三艘補給船追了上來，這些船隻也跟着威南號一同進入了斯里巴加灣。
至於其餘的艦船，至今卻還沒有見到他們過來集合的樣子。
全琮雖然心裏變得越發地着急起來，畢竟這是他第一次遭遇到這樣的狀況，這時候也只能夠向老天祈禱，讓其他失去聯繫的戰艦趕快趕過來纔好。
但是有些戰艦確實是永遠也趕不過來集合了。
大湖號戰艦本來在與海盜艦隊作戰的時候就有受損，後來又遭遇到了風暴的襲擊，船上的桅杆被大風吹斷，順着海流漂浮出了數百里之外，最終嚴重觸礁，導致船體近乎完全傾覆。
船上的士卒雖然竭盡全力進行修復，但是三個時辰之後，大湖號終於是徹底沉沒在南海，船上的七百人士卒從此全部失蹤。
另外損失的艦船還有兩艘繳獲的海盜船。餘下的兩艘直到半個月之後，才被由英勇號率領的另外八艘戰艦拖入了婆羅乃海灣。
而且，更加鬱悶的是，還有兩外的數艘戰艦因爲走錯了方向，最終停靠在了婆羅乃海灣入口北方的納閩島灣。
雙方其實已經都處於同一片海灣了，卻無法及時會合在一起，讓人白白擔心。直到後來全琮的艦隊駛出了婆羅乃海灣的時候，他們才發現了全琮的艦隊的蹤跡，匆匆忙忙地趕來會合。
他們需要在那裏的沿岸靠岸，一方面需要就地取材修復受損的艦船，另一方面也需要從陸地進行物資補給。畢竟，他們跟大部分的補給船都失散了，這一路上過來的時候，把物資消耗得非常嚴重。
當天下午時分，全琮下令讓警戒船進入婆羅乃河查看水文狀況，讓人欣喜的時候，河水的水深遠遠超出了預料，很多地方都有二十尺深，甚至於連威南號這樣超大型戰艦都可以安然進入。
於是，爲了不堵塞河面，以及保護海區的安全，全琮下令讓奮武號、熱誠號護衛着四艘損傷最爲嚴重的戰艦首先進入婆羅乃河。
而且，全琮爲了保護這些即將登陸的戰艦上面的人員的安全，畢竟這裏還是一片對於他們而言首次到達的地域，所以把用來應急之用的一千人水軍陸戰隊全部配備爲登陸的警戒部隊。
當天下午，這劉禪戰艦上面的所有船員便找到了合適的登陸地點，隨即都登上陸地，開始修建簡易的營地。
之所以需要這樣，主要是因爲修復所有戰艦需要動用大量的材料，需要營地囤積材料。
第二天，蜀漢軍士卒們開始在周邊開始採伐木材，根據預期，他們這樣的人手只怕需要半個月的時間才能夠將所有艦船都修復完畢。
第三天的時候，全琮派出另外三艘戰艦進入婆羅乃河，船上的人員登錄幫助岸上的人員展開工作。
然後，全琮傳令水軍陸戰隊之中的三百人脫離營區，進入島上展開搜索，看看是否有地方有人類居住，可以給他們提供各種生活物資。
其實，全琮他們根本不知道的是，就在距離河口處不到三十里的地方，其實就是當地的土著人的聚集區。
而且，就在全琮的艦隊開進斯里巴加灣的時候，行蹤就已經被他們所發現，對他們的動向展開了高度的關注。ァ新ヤ~8~1~中文網.. <首發、域名、請記住
而且，全琮艦隊的登陸部隊在陸地上面紮營，並且大規模採伐樹木的行爲，並未有得到他們那些當地土著居民的同意，立刻激起了他們的強烈不滿。
這支土著部落的手裏波瓜瓜立刻召集了底下的所有小頭目，商議要如何對那些身着奇怪衣服的傢伙展開懲罰和報復。
當即就有人高聲叫道：“大首領，我們瓜瓜部落在你的帶領之下天下無敵，我們部落的戰士也是個個神勇無敵，難道我們還需要怕他們幾個外族之人嗎”
那人的叫喊立刻引起了強大的共鳴，大家紛紛表示應該出動襲擊蜀漢軍。
得到大家的意見支持之後，波瓜瓜果然是個夜郎自大的傢伙，居然真的就同意了。於是，立刻召集了部落裏面的大約也有七八百人，帶着弓箭和簡易的武器就出發了。
碰巧的是，這時候全琮也向外排出了三百人的水軍陸戰隊對周邊進行搜索。
而這支人生地不熟的蜀漢水軍陸戰隊，隨即被波瓜瓜的人給盯上了，並且利用對當地的地形和環境極爲熟悉的因素，對他們展開了埋伏。
蜀漢軍受到突然襲擊，一時間也搞不清楚究竟是怎麼回事，只好立刻搜索陣型展開了防禦。他們這纔看到，包圍和襲擊他們的是一羣裸露着上半身，下半身隨便包着一些獸皮，皮膚頗爲黝黑的野蠻人
這些人的身上大多塗抹了一些迷彩的顏色，躲藏在樹叢裏面很難發現行蹤，有的人拿着簡易的長槍，有的則是在射箭。這些人的箭上顯然有毒，而且箭術不多，不斷有蜀漢軍被射中倒地。
蜀漢軍不敢戀戰，只有選擇快速撤退。
等到他們衝出包圍圈之後，已經損失了足有五十人。他們立刻回到營區報告。
全琮得到消息之後，心裏不由得有些憤怒，這些不知教化的野蠻人，單憑着那麼幾個人，居然就敢向大漢的軍隊挑戰了讓全琮忍不住想起來了夜郎自大的故事。
而且，五十個人雖然不算多，但是他的艦隊現在損失一個人就是減少一分戰鬥力，沒有辦法進行人員補充。
所以，全琮不敢怠慢。他並不想跟當地的土著起衝突，畢竟他的目的只是在這裏修復船隻，並且找到可以補給的地方而已，很快就要離開了。
於是，全琮也想要息事寧人，便派人探查到了波瓜瓜的部落所在地。
然後，全琮讓人準備了一些財物，讓使者帶着去跟當地的土著交涉，希望雙方能夠和平共處，而且也要向他們把被俘的水軍陸戰隊隊員給要回來。