期間，高順、張遼等人率數千幷州人馬從安門入城，擒下李儒、徐榮、胡軫，將未央宮牢牢掌控在手中；黃琬則率部及時封鎖了十二座城門。
一切都進行得很順利，甚至超乎王允等人想象。董卓被誅，不但京師百姓歡呼雀躍，就連禁軍將士也都喜出望外，並不做任何抵抗，紛紛乞降。
宮中禁軍，大多出自昔日雒陽北軍、西園各校。王允以皇甫嵩爲徵西將軍，讓其統率禁軍，與呂布的幷州軍一同西進，欲趁董不備，襲取塢。
與此同時，王允命李肅將董卓屍首棄於鬧市，滿城通告；又召集百官齊聚司徒府上，設宴同飲，以示慶賀。
酒宴上，文武百官全都喜形於色、彈冠相慶，唯獨左中郎將蔡邕喟然長嘆，王允遠遠瞥見，眼底隱有寒光閃動。
正在這時，尚書楊瓚進來通報道，“百姓聽聞董賊身死，全都歌舞於道，飲酒慶賀；李肅令人將大燭置於董賊臍中點燃，脂流於地，燭火不滅。”
“活該”
“大善”
場上衆人一聽，紛紛叫好。
“哎”
就在這時，席間傳來一聲嘆息，顯得極爲刺耳。衆人循聲望去，只見蔡邕以袖拭面，神色之間，難掩悲哀。
王允見狀，勃然變色道，“董卓可謂國賊，幾乎滅亡漢室，今日伏誅，乃是舉國幸事。諸君都在爲此歡慶，唯有蔡中郎發出悲嘆，不知何故”
蔡邕官居左中郎將一職，所以王允以蔡中郎相稱，擺明要公事公辦。
“蔡某一時感懷董卓知遇之恩，不覺嘆息，請王公見諒”蔡邕揖手道。
“蔡中郎身爲漢臣，豈可因其私恩，反而爲董賊傷痛”王允大怒道，“如此舉止，與那逆賊有何區別來人啦與我拿下此人，押入廷獄”
衆人一聽，全都大驚失色。按照舊例，一旦收入廷獄，幾乎就是死罪。
“蔡某雖然不才，卻也知曉大義。”蔡邕起身謝罪道，“怎會背國向董願受黥刖之刑，只求苟全性命，續成漢史，以贖今日之罪，請王公成全”
旁邊司空淳于嘉、尚書僕射士孫瑞等人紛紛出言求情。
王允不聽，執意讓人將蔡邕押走。
太尉馬日出列道，“伯喈曠世逸才，深悉漢事，若能續成漢史，當爲盛事且素有孝行傳世，若因小過而坐罪受誅，豈不讓天下士人大失所望”
當時論人，以孝廉爲首。
蔡邕年少時事母至孝，遠近聞名；他與族親關係也都極好，品行備受鄉里稱讚；後來校書東觀、授業龍門、祕言七事，更是名播海內，天下皆知。
“此言差矣”王允肅然道，“昔日武帝不殺司馬遷，任其作史，遂有誹謗之言流傳於世。如今國運衰微，朝政錯亂，怎可讓佞臣執筆於幼主左右”
“倘若留其作史，不但無益於宣揚聖德，反而會讓我輩受其非議”不等馬日再說，王允神色冷然道，“我意已決，馬公不必多說”
事情發展到這個地步，衆人全都意興闌珊，紛紛告辭而去。
剛出司徒府門，馬日就長嘆道，“王公這般作爲，恐怕難有後代傳承了善人爲國之楷模，史書爲國之經典，滅模廢典，怎麼可能長久”
次日一早，蔡邕即被鴆殺在廷獄之中。消息傳開，朝野俱驚。
皇甫嵩、呂布抵達塢的時候，董毫無所知，正在塢中安享酒色，宗族滿門老少當即盡數被誅，但史道人、貂蟬、董白全都消失不見。
結果抄得黃金兩三萬斤、白金八九萬斤，綾羅綢緞、奇玩古珍堆積如山。
中平六年八月，至初平二年四月，歷時兩年又八個月，董卓敗壞朝綱，禍亂百姓，危害之大，遠甚於黃巾之亂。
董卓及其宗族被誅身死，非但不是亂世的結束，反而只是一個開始。
董麾下數萬人馬，大部爲西涼士卒，其餘爲皇甫嵩舊部。前者聽說董氏一族覆滅，跟隨樊稠等人逃散；後者約有萬人，都主動向皇甫嵩請降。
塢之事一了，皇甫嵩、呂布押着所獲財物返回長安城。
按照事前的約定，呂布得爲奮威將軍、假節、儀比三司，封溫侯，名義上與司徒、尚書令王允共秉朝政。
光和七年歲旦，呂布在關中與滄月緣定十載，至今八年過去，終於得償所願，兩人雖未舉辦婚宴，滄月卻應約嫁入呂門之中。
呂布志得意滿之下，對朝政生出更多熱情，獨自來到司徒王允府上，正巧尚書僕射士孫瑞也在當場。
王允一見呂布，當即笑道，“聽聞奉先新得一美貌女郎，不留在府中享受溫柔，怎麼反而來找我這老頭子”
這一番話，王允說得客氣，其實暗藏玄機。其一，對呂布府中動靜，王允本人一清二楚；其二，朝堂大事，並非呂布一介武夫可以插手。
呂布毫無察覺，鄭重其事道，“董賊雖然伏誅，但西涼軍精銳尚有數萬，由牛輔、董越、段煨等人統領在外，不知司徒打算如何處置”
士孫瑞聽得神色一動，他今日來找王允，也是爲了這事。
“除董越外，此輩並無大罪，原本打算赦免。”王允沉吟道，“但衆人追隨董賊日久，終有惡逆之名，倘若特赦，反而讓其生疑，並非良策”
這番話說出來，不但呂布滿臉懵懂，士孫瑞也覺得異常費解。
“西涼軍素來悍勇，人數衆多，如果將其逼上絕路，後果不堪設想”呂布久經沙場，自有評判，“請司徒三思”
“奉先爲何膽怯”王允神色充滿自信，“董卓有暴羆之能，尚且被你我所誅，牛輔、董越等輩，不過豺狼鷹犬，必然聞風喪膽，何足道哉”
“呃”呂布被王允一激，不好作答，轉而建議道，“所抄董賊財物甚多，可否將其賜予朝堂公卿、軍中將校以便凝聚人心，防備萬一”
“董賊財物，劫掠自天下民衆，豈可隨意賞賜”王允斷然拒絕道。
呂布生性高傲，如今又以功臣自居，被王允連續拒絕，面上隱有怒氣。
“溫侯所慮者，無非西涼餘部。”士孫瑞見狀，開口道，“皇甫嵩威望甚高，何不讓他安撫西涼衆軍，屯駐陝縣同時派人聯絡關東，以觀其變。”
“僕射這話，大有道理。”呂布贊同道，“西涼與關東矛盾已久，倘若不能自保，反而容易生出禍患”
“此事不可”王允搖頭拒絕道，“關東興兵討賊者，都是我輩中人。如果留守險阻，雖然安撫了西涼衆人，卻難免惹關東羣雄生疑”
“哼”呂布大怒，拂袖而去。
眼見王允如此剛愎自用，士孫瑞大失所望，也起身告辭離開。次日一早，士孫瑞主動上書，以無功不受祿爲由，辭去王允剛剛授予的侯爵。