有魔法能力的孩子在出生時就被登記下來，他們會在11歲時收到貓頭鷹寄來的錄取通知書。
霍格沃茨學院共分爲四個學院，分別是格蘭芬多、赫奇帕奇、拉文克勞和斯萊特林，四個學院皆有其代表顏色與動物。新生入學後，第一件事情就是戴上分院帽進行分院，分院帽會根據你的性格和品質來判斷你該屬於哪一個學院。
霍格沃茨是一所全日制寄宿學校，位於英國蘇格蘭的某個黑湖旁的。
城堡中。城堡外有一片寬闊的草地，還有花壇和菜園。城堡邊有一個黑湖、一片茂密的禁林、幾座溫室和其他一些附屬建築，這裏也有貓頭鷹棚屋，學生和學校擁有的貓頭鷹全部居住在這裏。除此之外，還有一座標準的魁地奇球場。
霍格沃茨城堡最高的三座塔樓分別是天文塔、拉文克勞塔和格蘭芬多塔。城堡共有142處臺階，這些臺階有的又寬又大，有的又窄又小、搖搖晃晃；有的每逢星期五就通到不同的地方；有些上到半截，一個臺階會突然消失，因此，要記住在什麼地方應當跳過去，另外，這裏還有許多門，並且牆壁上掛有很多畫像和相片。門上畫像中的人物作爲看守者，如果，你不客客氣氣地請它們打開，或者確切地捅對地方，它們是不會爲你開門的；還有些門根本不是真正的門，只是一堵堵貌似門的堅固的牆壁。想要記住哪些東西在什麼地方很不容易，城堡中的一切都在“不停地移動”，包括所有的樓梯臺階。前校長阿不思·鄧布利多曾說就連自己也不知道霍格沃茨城堡的所有祕密，因爲這座城堡歷史悠久。
所有巫師在霍格沃茨中都無法幻影移形，他們只可以使用飛天掃帚或飛路粉，或者搭乘騎士公共汽車或幻影移形到學校附近的地點，再步行到達學校。霍格沃茨的學生開學時，需要搭乘霍格沃茨特快列車到達霍格莫德車站，新生通過仿照千年前四大創辦者划船的方式，渡湖到達霍格沃茨，老生則乘坐夜騏拉的馬車到達學校。霍格沃茨附近被施了麻瓜驅逐咒，讓麻瓜無法接近這裏。他們看不到學校的樣子，只能看見一堆破敗的廢墟，還有入口處寫着“危險，不得進入，不安全”的牌子。麻瓜的電子儀器和設備都不能在霍格沃茨使用，因爲霍格沃茨周圍充滿強烈的魔法磁場，會對電子設備產生強烈的干擾，但是，無線電設備除外，因爲魔法世界使用的無線電設備並不是通過電力啓動，而是靠魔法。
學生在校有優異表現或貢獻，除了能爲自己的學院贏得分數外，也有可能獲得“特殊貢獻獎”。湯姆·裏德爾、哈利·波特、羅恩·韋斯萊都曾獲得此獎項。相反，若觸犯校規，不但會被扣分，還有可能被關禁閉；關禁閉有很多種形式，例如：不用魔法進行清潔工作、或協助獵場看守魯伯·海格到禁林巡邏等。
霍格沃茨學院是公元990年左右創辦的。創辦者是當時最偉大的四位巫師：戈德里克·格蘭芬多、薩拉查·斯萊特林、羅伊納·拉文克勞、赫爾加·赫奇帕奇。學校的四個學院就是以他們的名字命名的。他們建立學校，遠離麻瓜們窺視的目光，因爲，在當時那個年代，麻瓜們畏懼魔法，很多男女巫師都遭到迫害。他們每個人都有自己的個性，並在挑選學生時展現出來。可是，慢慢地，他們之間就有了分歧。薩拉查·斯萊特林就血統成分的問題，和另外三人發生了分歧。薩拉查·斯萊特林只希望招收純血統的學生。不久後，薩拉查·斯萊特林和戈德里克·格蘭芬多因爲這個問題，發生了一次激烈的爭吵，然後薩拉查·斯萊特林便離開了學校。離校前，薩拉查·斯萊特林在城堡裏建了一個密室，其他創辦者對此一無所知。薩拉查·斯萊特林封閉了密室，直到他真正的繼承人來到學校，只有那個繼承人能夠開啓密室，把裏面的恐怖東西放出來，讓它“淨化”學校，清除所有不配學習魔法的人（麻瓜出身的巫師）。
1942年，密室被湯姆·裏德爾第一次打開，他是薩拉查·斯萊特林的繼承人，也是未來的伏地魔。密室打開後，一名叫桃金娘的女孩被密室中的怪物殺害，魔法部威脅關閉學校。湯姆·裏德爾害怕他從此返回麻瓜孤兒院，他沒有想到要學校關閉，因此他嫁禍於三年級學生魯伯·海格和魯伯·海格養的八眼巨蜘蛛阿拉戈克，導致魯伯·海格被開除，湯姆·裏德爾也因此獲得學校的特殊貢獻獎。
1991年，由於藏在古靈閣713號金庫的魔法石安全受到威脅，校長阿不思·鄧布利多將魔法石轉移到了霍格沃茨四樓靠右側走廊下方的密室裏，並與其他老師一起設置了防禦機關。但時任黑魔法防禦術教師奎里納斯·奇洛（已成爲黑巫師，並被伏地魔附身）還是突破了其他老師設置的所有防禦機關，而受阻於阿不思·鄧布利多親自佈下的厄里斯魔鏡前。一年級學生哈利·波特與兩個朋友羅恩·韋斯萊、赫敏·格蘭傑一起合作，穿越衆多機關。哈利·波特與奎里納斯·奇洛搏鬥並守住魔法石，但自己也險些喪命。後來阿不思·鄧布利多趕到，救下哈利·波特。魔法石則按照阿不思·鄧布利多和尼可·勒梅的意願被銷燬。
1992年，在湯姆·裏德爾的日記的影響之下，金妮·韋斯萊被湯姆·裏德爾的記憶迷惑，密室由金妮·韋斯萊第二次打開。密室中的怪物襲擊並石化了四名麻瓜出身的學生、格蘭芬多幽靈“差點沒頭的尼克”和啞炮管理員阿格斯·費爾奇的貓洛麗絲夫人。原來是盧修斯·馬爾福偷偷將湯姆·裏德爾的日記放在她的變形術課本里，藉此誣陷她的父親亞瑟·韋斯萊，使亞瑟·韋斯萊出臺的麻瓜保護法被否決。但是，哈利·波特和羅恩·韋斯萊發現了真相。哈利·波特摧毀了日記，殺死了密室中的蛇怪，還救出了被湯姆·裏德爾的記憶控制進入密室的金妮·韋斯萊。而在校醫波比·龐弗雷夫人和草藥學教師波莫娜·斯普勞特教授的幫助下，所有被蛇怪石化的人、幽靈和動物都被成功救活。
1993年，由於魔法部認爲小天狼星·布萊克逃出巫師監獄阿茲卡班是爲了潛入霍格沃茨殺死哈利·波特，所以派遣大批攝魂怪進駐霍格沃茨，而霍格沃茨本身也加強了各種安全措施。但小天狼星·布萊克仍然潛入（因爲小天狼星·布萊克是阿尼瑪格斯），並躲藏在霍格莫德的尖叫棚屋。之後哈利·波特、羅恩·韋斯萊、赫敏·格蘭傑三人同當時的黑魔法防禦術教授萊姆斯·盧平（狼人）發現小天狼星·布萊克是無辜的，真正出賣了哈利·波特父母的泄密者是小矮星彼得（阿尼瑪格斯），哈利·波特等人抓住了變成老鼠斑斑的小矮星彼得，但當時恰好是月圓之夜，萊姆斯·盧平變身成爲狼人，小矮星彼得乘機逃走。後來魔藥學教授西弗勒斯·斯內普甦醒後，將哈利·波特等三人和小天狼星·布萊克運回城堡，準備將小天狼星·布萊克交給攝魂怪進行“親吻”。但是校長阿不思·鄧布利多教授相信了哈利·波特和赫敏·格蘭傑的說辭，讓兩人通過時間轉換器回到過去，救下將被處決的鷹頭馬身有翼獸巴克比克。隨後哈利·波特用呼神護衛驅逐了大批攝魂怪，救了原來的自己，又和赫敏·格蘭傑一起騎上巴克比克，救出小天狼星·布萊克，讓他騎着巴克比克逃走了。