曾國藩屢接胡林翼求援諮，不置可否，上疏咸豐帝：賊若擄上游無數之民船，搶漢鎮新造之戰舟，梗塞江漢之間，則大江千里，上下皆賊。臣等水軍裹於中斷，錢糧子藥來源已截，水勇之心，斷難自固。若果重踞武漢，西窺荊襄，南伺湘省，防不勝防，其可慮者一也；若使臣等一軍回駐武漢，則艱難百戰，肅清江面，，一旦委而棄之，實屬可惜。且臣等水師西旋，九江、湖口之賊，勢必內犯江西，臣等此後軍餉更難仰給於江省。且陷入內湖之戰舟百餘，精銳二千，從此斷難衝出，與外江水師會合，年餘講求練此精華，一旦置之無用之地，後日難以再振，其可慮者二也。陸軍屢勝之餘，士氣極盛，自至九江、湖口攻城攻壘傷亡健卒多至數百人，銳氣挫損。若使一意前進，得勝仗數次尚不難於振刷精神，再接再厲。若使回軍武漢，則兵勇之雄心先減，加以遠道跋涉，消磨精氣，雖認真振厲，亦難作其方新之氣，其可慮者三也。
陳士傑道：“羅澤南意，武昌得失，事關全局。林源恩悍勇，堪軍旅，滌帥飭其兩治糧臺，誤其才矣！鏖戰半載，所獲甚少，兵疲將離，亟應另謀出路。大軍西進，攻擊武昌，自是正道。”
曾國藩道：“吾視源恩面相，宜治糧臺；既有才，即任水師營官。年初水師被賊焚，吾至南昌，募勇造船。再至吳城，又至這南康，偕李元度平江勇、蕭捷三水師，與黃文金、胡鼎文、李遠繼賊逆，鏖戰十餘場，鄱陽湖面，終得澄清。大軍西進，此全舍乎？”
陳士傑道：“偏安湖面，無益大局；武昌得克，浩蕩而下。”
曾國藩道：“吾等踞九江，扼斷長江之腰膂；上有金口水軍，以擊其首；下有紅單戰船，以擊其尾。二千餘里之江面，分爲三段，剿辦或有肅清之期。吾令：羅澤南再接再厲，肅清江西腹地；李元度偕蕭捷三水師，北攻湖口；塔齊布砥礪心志，暫緩取潯，轉擊湖口；三軍合力，內外夾擊，湖口彈指或破。”
陳士傑道：“贛撫陳啓邁，近愈掣肘，糧餉竟不供給，萬載縣舉人彭壽頤，滌帥委之用之，而陳卻押之入獄。江西士紳怵陳淫威，再不資我。”
曾國藩道：“此落井下石、恨人不滅之舉，孰可再忍！”
是夜，國藩奏曰：竊惟東南數省，賊勢蔓延，全賴督撫得人，庶幾維持補救，轉危爲安。臣至江西數月，細觀陳啓邁之居心行事，證以輿論，實恐其貽誤江省，並誤全局，有不得不縷陳於聖主之前者。
已革總兵趙如勝，系奉旨發往新疆之員。上年奏留江省效用，陳啓邁派令管帶戰船百號、水勇四千餘人、大小炮位七百餘尊。十一月初五紮泊吳城鎮，一聞賊至，趙如勝首先奔逃，各兵勇紛紛獸散，全軍覆沒，船隻炮械盡爲賊有。其實賊匪無多，民間至今相傳僅長髮九十餘人耳。聞風先逃，殊可痛憾。
乃陳啓邁入奏之詞，則曰趙如勝奮不顧身，力戰終日，其所失船數百餘、炮數七百，並不一一奏明，含糊欺飾，罔恤人言。又派趙如勝防堵饒州等處，正月間敗逃三次。賊破饒州，陳啓邁含混入奏，不惟不加趙如勝之罪，並其原定新疆罪名，亦曾不議及，始終怙非袒庇，置賞罰綱紀於不問。
已革守備吳錫光，系被和春參劾、奉旨正法之員。吳錫光投奔江西，籲求救全。陳啓邁奏留江西效用，倒填日月，謂留用之奏在前，正法之旨在後，多方徇庇，虛報戰功，既奏請開脫罪名，又奏保屢次超生，又奏請賞給勇號。
正月二十九日，吳錫光縱其麾下貴州勇無故殺死龍泉勇一百八十七名，合省軍民爲之不平。陳啓邁既不奏聞，又不懲辦，乃於武寧縣內取他省之勇曾經犯案者，假稱貴勇，縛而殺之，以掩衆人之耳目。而衆人愈積憤於吳錫光，道路以目矣！
饒州之賊屯聚於四十里街，三月二十八日，吳錫光攻剿饒州，僅殺賊數十人，此坤庶所共見共聞。而陳啓邁張皇入奏，謂克服饒郡，殺賊三千，焚船百餘，吳錫光與其子侄，均保奏超升；即素在巡撫署內管賬之胡應奎亦隨折保奏。
義寧州之陷，實系興國、崇、通土匪居多，長髮尚少，吳錫光驕矜散漫，倉卒敗亡，並非有大股悍賊與之交鋒也。乃陳啓邁粉飾入奏，則鏖戰竟日，殺賊千餘。
吳錫光薪水、口糧，較別營獨多，且帶勇七百，支領八百人之餉，此陳啓邁所面囑司道總局者。乃入奏則曰，系自備資斧。種種欺飾，實出情理之外。
自軍興以來，各路奏報，飾勝諱敗，多有不實不盡之處，久爲聖明所洞鑑，然未有如陳啓邁之奏報軍情，幾無一字之不虛者。茲風不改，則九重之上，竟不得外間之虛實安危，此尤可慮之大者也。
臣等一軍，自入江西以來，於大局則慚愧無補，於江西則不爲無功。塔齊布駐九江，防陸路之大股；臣國藩駐南康，防水中之悍賊；羅澤南克復一府兩縣，保全東路。此軍何負於江西，而陳啓邁多方掣肘，動以不肯給餉爲詞。
臣軍前後所支者，用侍郎黃贊湯炮船捐輸銀四十餘萬兩、奏準漕折銀數萬，皆臣軍本分應得之餉，並非多支藩庫銀兩。即時盡取之江西庫款，凡餉項絲毫，皆天家之餉也，又豈陳啓邁所得而私乎？乃陳啓邁藉此挾制，三次諮文，迭次信函，皆雲不肯給餉，以此制人之肘而市己之恩。臣既恐無餉而兵潰，又恐不和而誤事，不得不委曲順從。
羅澤南克復廣信以後，臣本欲調之折回饒州、都昌，以便與水師會攻湖口。陳啓邁則調之防景德鎮，又調之保護省城，臣均已曲從之矣。旋又調之西剿義寧，臣方覆函允從，而陳啓邁忽有調往湖口之信；臣又覆函允從，陳啓邁忽有仍調往義寧之信。朝令夕改，反覆無常，雖欲遷就曲從而有所不能。
二月間，臣與陳啓邁面商江西亦須重辦水師，造船數十號，招勇千餘人，以固本省鄱湖之門戶，以作楚軍後路之聲援，庶與該撫正月之奏案相符。陳啓邁深以爲然，與臣會銜札委河南候補知府劉於淳董其事。業已興工造辦，忽接陳啓邁諮稱，江西本省毋庸設立水師，停止造船等因。臣既順而從之矣，因另札劉於淳在市汊設立船廠，專攻臣軍之用。忽又接陳啓邁諮稱，欲取廠內船隻，交吳錫光新募之水軍；文飭令廠內續造十五號。船廠委員亦遵從之矣。迨船既造成，陳啓邁又批飭不復需用。悠要船悠不要船，悠立水軍悠不立水軍，無三日不改之號令，無前後相符之諮札。不特臣辦軍務難與共事，即爲屬員者亦紛然無所適從。