這可謂是一個歷史性的變革，不僅使得內閣大學士通過加銜再度提升了品階，而且內閣首輔楊士奇由於少保的加銜，在品階上已經超過了那些加銜低於少保的六部尚書。
洪熙帝時，爲了提高內閣的地位，給正五品的內閣大學士都進行了加銜，以提高其官階。
於是，楊士奇兼禮部左侍郎，楊榮兼太常寺卿，金幼孜兼戶部右侍郎，官階從正五品躍升爲正三品。
有一點必須要明確的是，大學士“兼”的尚書、侍郎等職務爲虛職，只是一個加官而已，用來提高本身的品級，並不處理所加官職部院的事務。
這個問題其實很簡單，內閣是一套機構，內閣閣員在文淵閣當值，擁有着大明政務的議政權。
而府六部是另外一套機構，尚書、侍郎和都督在各大部院衙門當值，擁有着大明政務的行政權。
雙方是兩套平行的系統，互不統屬，各司其職。
先不說有人要是同時在這兩個機構擔任要職的話會分身乏術，如果相互間可以進行兼任的話，那麼也沒有必要設立內閣了，直接讓六部尚書來充當內閣閣員的角色皆可。
可如此一來，議政權和行政權還是都落在了六部的手裏，使得六部權力過大，容易滋生yankuai，尾大不掉，故而皇帝要進行分權。
必須要先說明的是，禮部尚書的情況有些特殊，另當別論。
因此，內閣和六部的關係就很好理解了，既相輔相成，又相互制約。
至於後來爲何內閣時常會凌駕於六部之上，要想弄清楚這裏面的關係，還要從內閣的特殊性質來說起。
內閣成立之初只是皇帝的祕書機構，內閣的閣員並不一定要在五府六部裏做過事情，例如楊榮和楊士奇，就從未在六部裏擔任過職務，而是以翰林的身份直接入閣。
後來，由於內閣權勢日盛，隨着時間的推移，逐漸規定只有翰林出身的侍郎、尚書纔有資格入閣，這就使得內閣和六部之間的關係變得複雜了起來。
而一旦六部的侍郎、尚書入閣後，那麼他們將從六部離職，不再擔任六部中的職務，會有新的尚書或者侍郎來取代他們，不過他們在六部的職務通常成爲一種表示榮耀的加官。
例如，嘉靖二十三年，吏部尚書許贊在兼文淵閣大學士入閣後，吏部尚書一職由熊浹接任，這意味着許贊不再是吏部的人。
入閣後，許讚的身份是吏部尚書兼文淵閣大學士。
由此一來，大明看上去就有兩個吏部尚書，但由於許贊是大學士，故而他的吏部尚書只是一種加官，並不能干涉吏部的部務，吏部的部務由熊浹主管。
進入內閣後，許贊手中的權力大減，這使得他不由得哀嘆，“何奪我吏部，使我旁睨人！”
故而，許贊在嘉靖二十四年就引職乞休，並且忤逆了嘉靖帝讓他留任的旨意，落職閒住，足見其在擔任吏部尚書和大學士時權力待遇的巨大反差。
通常來說，吏部尚書位於六部尚書之首，號稱“天官”，故而吏部尚書一般不入內閣，以免形成尾大不掉之勢，而以次之的吏部的侍郎入閣。
而那些掛着吏部尚書頭銜的大學士，基本上都沒有在吏部擔任過尚書，只是一種表示榮譽的加銜而以。
在六部尚書中，最爲清閒的禮部尚書和工部尚書反而最容易入閣，而禮部尚書通常會成爲首輔。
如果六部的官員入閣後依然“兼任”着六部的職務，其在六部的職務沒有被新任的官員取代，那麼官銜之間就不能用“兼”字，而是用“掌”或者“判”等差遣用詞。
以高拱和方獻之爲例，兩人是大明歷史上僅有的兩個以吏部尚書入閣，並且還依舊在吏部擔任着尚書的人，名爲“掌”部事。
不過，方獻之很快就不再兼任吏部尚書，而高拱則屬於隆慶皇帝的特殊照顧。
至於嚴嵩和張居正等人，他們擔任大學士的時候雖然都有吏部尚書的頭銜，但那是加官而已，並不負責吏部的事務，吏部有一位實職尚書在處理日常事務。
有一點值得一提，由於禮部事務清閒，而且權力有限，故而禮部尚書入閣後時常會保留其禮部尚書的職務，既是內閣的大學士，同時也是禮部的尚書，屬於特例。
洪熙帝時，楊士奇、楊榮和金幼孜的官階還位於六部尚書之下，與六部侍郎平齊。
以楊士奇爲例，他擔任大學士只是正五品的官階，加官禮部左侍郎後成爲了正三品的官階。
當然了，楊士奇的禮部左侍郎是一個加官，並不是實職，故而不管理禮部的事務，禮部的事務由一名實職的禮部左侍郎處理。
正是由於有這種加官的體系，故而明朝歷史上同一時期會出現幾個人擁有同一職務的現象，不過其中只有一個人的官職是實職，其他的都爲虛職，屬於加官。
少保屬於三孤，即少師、少傅和少保，是從一品的榮譽官職，只用來晉升官銜，並沒有實際的職務。
故而，有了少保的加銜後，楊士奇的官階已經提升爲了從一品，超過了六部尚書的正二品官階。
縱觀有明一代，正二品已經是官員的頂級官階，至於從一品的和正一品的能獲得者非常少，通常是死後追授，再或者是享受無上的皇**。
因此，六部中只有兩個人的官階位於楊士奇之上，那就是有着少師頭銜的吏部尚書蹇義，以及有着少保兼太子少傅頭銜的戶部尚書夏元吉。
即使有着太子太保頭銜的禮部尚書呂震，官階都要位於楊士奇之下，因爲少保和太子太保雖說都是從一品的榮譽官職，但是少保屬於三孤，位於太子太保的太子三師之前。
說到三孤和太子三師，那麼必須要明確明代正一品、從一品和正二品的榮譽官職體系。
正一品有三公：即太師、太傅和太保，除了極個別人外，只有死後追授。
從一品有兩個：三孤和太子三師。
三孤即少師、少傅和少保，太子三師即太子太師、太子太傅和太子太保，其中三孤爲尊，位於太子三師之前。
正二品有太子三少：即太子少師、太子少傅和太子少保。
在這些榮譽官職體系裏，同一級中，“師”爲尊，“傅”次之，“保”末等，由此給官員進行排位。