原因就在於李隆基在朝堂上變的越來越強勢，讓太平公主感受到了莫的壓力。再加上她從心裏十分渴望崔子陵可以常伴自己左右，要想實現這一切，只能是先把李隆基扳倒。畢竟崔子陵是自己的情人，又是李隆基的朋友，她可不想看着自己心愛的人左右爲難。
太平公主與竇懷貞、岑羲、蕭至忠以及太子少保薛稷、雍州長史新興王李晉、左羽林大將軍常元楷、知右羽林將軍事李慈、左金吾將軍李欽、中書舍人李猷、右散騎常侍賈膺福、鴻臚寺卿唐和胡僧慧範等一起圖謀廢掉唐玄宗，此外，太平公主又與宮女元氏合謀，準備在進獻給李隆基服用的天麻粉中投毒。
而他們經常在一起密謀的事，也早已被李隆基知曉，他之所以不動聲色是因爲他覺得此時與太平公主攤牌，自己並無必勝的把握。
王琚對李隆基進言道：“形勢已十分緊迫，陛下不可不迅速行動了。”尚書左丞張說從東都洛陽派人給李隆基送來了一把佩刀，意思是請玄宗及早決斷，剷除太平公主的勢力。荊州長史崔日用入朝奏事，對李隆基說：“太平公主圖謀叛逆，是由來已久的事情。當初，陛下在東宮作太子時，在名分上還是臣子，如果那時想剷除太平公主，需要施用計謀。現在陛下已爲全國之主，只需頒下一道制書，有哪一個敢於抗命不從？如果猶豫不決，萬一奸邪之徒的陰謀得逞，那時候再後悔可就來不及了！”李隆基說：“你說得非常正確，只是朕擔心會驚動太上皇。”崔日用又說道：“天子的大孝在於使四海安寧。倘若奸黨得志，則社稷宗廟將化爲廢墟，陛下的孝行又怎麼體現出來呢！請陛下首先控制住左右羽林軍和左右萬騎軍，然後再將太平公主及其黨羽一網打盡，這樣就不會驚動太上皇了。”李隆基認爲他說得很對，便任命他爲吏部侍郎。
魏知古告發太平公主發動叛亂，指使常元楷、李慈率領羽林軍突入武德殿，另派竇懷貞、蕭至忠、岑羲等人在南牙舉兵響應。李隆基於是與岐王李範、薛王李業、郭元振以及龍武將軍王毛仲、殿中少監姜皎、太僕少卿李令問、尚乘奉御王守一、內給事高力士、果毅李守德等人定計率先下手誅除太平公主集團。甲子（初三），李隆基通過王毛仲調用閒廄中的馬匹以及禁兵三百餘人，從武德殿進入虔化門，召見常元楷和李慈二人先將他們斬首，在內客省逮捕了賈膺福和李猷並將他們帶出，又在朝堂上逮捕了蕭至忠和岑羲，下令將上述四人一起斬首。竇懷貞逃入城壕之中自縊而死，唐玄宗下令斬戮他的屍休，並將他的姓改爲毒氏。李旦聽到事變發生的消息後，登上了承天門的門樓。郭元振上奏李旦說：“皇帝只是奉太上皇誥命誅殺竇懷貞等奸臣逆黨，並沒有發生什麼其他的事。”李隆基也隨後來到門樓之上，李旦於是頒發誥命列舉竇懷貞等人的罪狀，並大赦天下，只是逆臣的親屬黨羽不在赦免之列。薛稷被賜死在萬年縣獄中。
李隆基決定下詔處死太平公主，太上皇李旦出面爲太平公主求情，希望他可以念在親情上網開一面，免除太平公主一死，也被李隆基給拒絕了。因爲他一直處於太平公主的陰影之下，壓抑的太久了，這一刻終於爆發了！
李隆基下詔將太平公主賜死在家中，她的兒子盡數押赴刑場處死。薛崇簡因爲平日屢次諫阻其母太平公主而受到責打，所以例外地被免於死刑，李隆基賜他姓李，並准許他留任原職。唐玄宗還下令將太平公主的所有財產沒收充公，或許是爲了考驗崔子陵，也或許是覺得他畢竟與自己的姑母相好一場，也好送自己的姑母一程，特意命崔子陵與陳玄禮前往太平公主府傳旨並執行。當然李隆基更深層的意思還是想告訴崔子陵，幸虧他沒有參與這件事情，早早與太平公主斷了聯繫，否則現在也必將身首異處！
先天政變後，李隆基終於擺脫了有名無實的尷尬境地，當上了名副其實的真皇帝，最終結束了自中宗朝以來朝局多年混亂的局面。