元始天尊懲罰了違背天道的多寶道人，隨之絕仙陣也就覆滅了，多寶道人邪惡之體均已被元始天尊所誅殺，靈魂得到烈火的焚燒已潔淨昇華，最終魂歸封神榜，等待姜尚伐商興周之大業完成後，封神臺上封禪諸位新天神，以正乾坤。元始天尊這時動用意念察覺而出，闡截兩教之劫數固然如期而至，起因乃是闡教叛徒申公豹，元始天尊對弟子姜尚言道：“姜尚聽命，本尊命你到三十六重天之兜率宮。將你師叔道德天尊請到此處，兩教有此一劫只有道德師弟能化解此劫。”
這時闡教叛徒申公豹從絕仙陣逃出之後，立刻前往碧遊宮通天教主之住處，申公豹不顧顏面直往裏闖，申公豹邊闖邊叫苦言道：“通天師叔，您要爲多寶師兄報仇雪恨。”通天教主對申公豹言道：“申公豹，多寶有此一劫。本尊奉勸於爾，就此收手且莫再違背天道。而赴了多寶之後塵，以周代商乃天意所爲。”申公豹聽得此言，便開始了一番顛倒乾坤之言語，申公豹對通天師叔言道：“師叔啊，您可知修道之人是怎麼評價截教中人歟？”通天教主一語不發就想聽聽申公豹如何編排與挑撥兩教關係的，通天教主對申公豹言道：“師侄不急，坐下慢慢對本尊言之。”申公豹見得師叔如此待他，於是就放心來坐下開始顛倒乾坤了。
申公豹對通天師叔就暢所欲言道：“通天師叔，那些修道之人說截教就是......。”通天教主言道：“師侄，本尊今恕你無罪。”申公豹繼續言道：“截教就是畜生之道，就算修到高處卻還是畜生。”通天教主聽得此言，發出雷霆之怒。通天教主震怒的對申公豹言道：“大膽申公豹，竟然在本尊面前侮辱本教。看來師兄元始天尊做的對，像爾等這般叛徒且死有餘辜。申公豹休得逃走，本尊要爲闡截兩教清理門戶。”申公豹聽得此言之後，於是立刻向通天教主繼續顛倒是非。
申公豹再次對通天教主言道：“通天師叔，弟子怎敢對師叔您不敬。此類侮辱截教之言，實乃出自我師父元始天尊之口。弟子若有半點虛言，請師叔嚴懲。”通天教主見得申公豹神情嚴謹毫無虛言之狀，就收起誅仙劍再次讓申公豹坐下言談，通天教主對申公豹言道：“申公豹，爾今被師兄元始逐出師門。拜本尊爲師，可願於否。”申公豹聽得此言甚爲欣喜，立刻跪地就拜，申公豹向師尊通天教主言道：“通天師尊在上，受弟子申公豹一拜！”通天對申公豹言道：“申公豹，事不宜遲。即刻隨爲師修煉誅仙陣，待此陣法修煉完畢之時，乃闡教衆仙陣亡之日。”
通天教主領着申公豹就進入關內進行修煉，分別有三位師兄在修煉其他三陣：暗淵道人坐鎮誅仙陣、金光道人坐鎮戮仙陣、龜靈道人坐鎮陷仙陣、申公豹坐鎮絕仙陣，四陣法寶分別是：離火誅仙劍、澤兌戮仙劍、水坎陷仙劍、雷震絕仙劍。之前多寶道人佈下的絕仙陣乃是小試牛刀，這次乃是通天教主親自坐鎮的誅滅萬仙陣，通天教主受了申公豹的蠱惑，擺出了天下至惡之陣法，想與兩位師兄在此陣法上一決高下，並且還收下了闡教叛徒申公豹，以此挑戰元始之底線。
自上次多寶道人被元始天尊所誅殺之後，元始天尊啓用慧靈觀察三界發現闡截兩教劫數難逃，就命楊戩去找道德天尊前來化解此劫數，楊戩到了三十六重天的兜率宮時，正逢道德天尊在與靈寶、準古兩大天尊在商討此事，楊戩在兜率宮外等了好一陣，道德天尊、靈寶天尊與準提天尊，三聖隨楊戩步入凡塵拯救黎民。楊戩將三聖請到西岐與師祖元始天尊匯合，女媧聖尊則在西岐幫楊嬋提升寶蓮燈的最高法術，因爲此戰之決勝全靠寶蓮燈與無字天書之力量來把握全場了，女媧聖尊也將捲入此次封神之決戰，元始天尊命令傳下，令十二金仙下山助戰，屆時廣成子、赤精子、黃龍真人、懼留孫、太乙真人等十二位金仙下山剷除誅仙。
元始天尊率領楊戩、楊嬋等六員神將攻入暗淵道人把守的誅仙陣，到了誅仙陣用眼望去只見門前懸掛着一鐏非銅非鐵亦非鋼之神劍，元始天尊見得此神劍直言道：“楊戩，爾等要慎之又慎。”楊戩反問元始師祖言道：“師祖，爲何卻這般懼怕？”元始天尊回楊戩言道：“楊戩有所不知，爾可聽言之。非銅非鐵亦非鋼，須彌山下萬年藏。乾坤顛倒陰陽煉，無澤烽火鑄鋒芒？利誅仙，仙戮亡，四方陷仙起赤光。無窮變化絕仙妙，遠古金仙血染裳。”楊戩等六員神將聽得元始師祖如此描述誅滅萬仙陣，覺得此番封神決戰真乃史無前例之戰，自告奮勇之。
首先由四大天尊到誅滅萬仙陣一探虛實，元始天尊來到了暗淵道人持守的誅仙陣，暗淵道人向元始師伯言道：“元始師伯，今如能破得此陣，吾將退之。若無法破得此陣，那就勿怪師侄冒犯於您，定削去師伯與爾等之頂上三花。”楊戩向暗淵道人狂怒言道：“暗淵老賊，切莫狂言欲出。可還記得吾之楊戩，爾等曾是吾手下敗將。如今得了通天師叔祖之真傳，不曾勸阻通天師叔祖，反而縱涌師叔祖與天道相背馳。暗淵老賊，休走，喫某一戟。”楊戩言罷，就陷入了戰鬥。
此暗淵並非彼暗淵，暗淵道人還在陣前道臺之上坐着呢，與楊戩開戰之暗淵乃是暗淵之靈，元始天尊命楊嬋言道：“楊嬋，快拿出寶蓮燈，使用聖燈之光，清除楊戩邪惡之念。若不及時清除，則後患無窮。”楊嬋立刻拿出寶蓮燈，使用七彩聖光消除了楊戩的邪惡之念，等楊戩清醒之後才發現，差點將自己戰死。暗淵道人運用的是邪惡之淵道法，開啓神人之間的邪惡之淵，使開啓之人自我消亡。元始天尊對楊戩言道：“楊戩，可還記得玉鼎，對你之教誨否？”楊戩此時雙目緊閉盤膝而坐，啓用內心深處之靈宙在領悟道語，此時只見楊戩之天眼發出了道道金光，楊戩領悟了玉鼎真人之道，功力增長了數萬倍，能匹敵此陣之力量。
道德天尊降臨在金光道人持守之戮仙陣，金光道人向道德師伯言道：“道德師伯，吾之金光奉勸於您。此戰乃是我截教與元始師伯之闡教之戰，與道德師伯毫無相干，望師伯切勿參與此戰之中。若要一意孤行，三教來一場萬仙之戰。”道德天尊震怒言道：“金光師侄，本尊乃爾等師伯。竟如此高傲，待本尊收了爾等！再找通天師弟比試較量，爾等休走，看道德八卦鏡。”待道德天尊請出法寶之時，通天教主親臨萬仙陣，通天教主向道德天尊言道：“師兄且慢，饒之性命。”