卡拉巴的奧多姆拉號迦樓羅級大型航空運載母艦，被布蘭·布爾達克的nrx-044亞希瑪（南瓜頭）不斷騷擾，阿姆羅駕駛着運輸機恰巧遇見這一戰鬥場面，阿姆羅也敏銳的察覺到了夏亞和另一位新人類卡繆的存在。
目睹戰鬥過程的阿姆羅，體內戰鬥之血燃燒，阿姆羅讓卡茲先行使用降落傘離開，然後自己駕駛運輸機撞向了nrx-044亞希瑪。在第一部主角光環的加持下，和卡繆等人纏鬥了5集的nrx-044亞希瑪，被阿姆羅用沒有武裝的運輸機撞毀。
劇情到這裏結束，官方推出了一個50vs50的小型副本，用來模擬交戰雙方。這裏有雙重隱藏任務，第一重任務是樓宇的任務，‘接住下落的阿姆羅’。第二重任務是‘出擊的小林卡茲’。
樓宇的任務較爲簡單，就是接住在撞擊過後，阿姆羅從破碎的擋風玻璃處用降落傘成功逃離，原著中是卡繆的mk-2接住了阿姆羅，夏亞的百式也在一旁觀看。但是有了樓宇的介入，一切都改變了，元祖高達劃過一道流光衝向阿姆羅，元祖高達的出現讓夏亞和阿姆羅都是一愣，元祖高達開啓增益裝甲搶在卡繆的mk-2之前到達。
突然出現的機體嚇了卡繆一跳，卡繆下意識的掏出了武器，夏亞及時制止了卡繆的攻擊行爲並告知這就是一年戰爭期間的功勳機體rx-78-2元祖高達。樓宇穩穩的接住了阿姆羅。
夏亞和卡繆也飛了過來，三臺機體的駕駛艙一同打開。阿姆羅掃視了一眼，嘴裏嘟囔道：“夏亞、藍色彗星還有另一個新人類嗎？”三臺機體帶着阿姆羅和之前跳傘的小林卡茲飛回了奧多姆拉號。
由於樓宇的陣營是卡拉巴，所以小林隼人見到樓宇的元祖高達並不意外。阿姆羅倒是饒有興致的撫摸着因爲裝備了增益裝甲外形有所改變的元祖高達。小林隼人詢問樓宇凱·西汀的動向，此時的凱爺應該在風眠公會的格納庫和米海爾談情說愛，樓宇不知道該如何向小林隼人解釋，只能告訴小林隼人，凱爺十分安全。小林隼人也沒有多問，因爲有三位主角的視線已經碰撞在了一起。
夏亞向卡繆介紹阿姆羅，阿姆羅面對昔日的死敵夏亞暫時放下了成見，但是偏執小孩卡繆上線，詢問阿姆羅爲何不繼續在宇宙中戰鬥。卡繆的問題直刺阿姆羅痛處，阿姆羅並沒有過多的解釋，只是默默離開。夏亞評價阿姆羅爲‘被地球重力束縛住的人’。
第一重任務結束，樓宇的元祖高達被留在了奧多姆拉號。獲得了1臺本該阿姆羅使用的msa-099力克·迪亞斯和1張msa-003雷姆設計圖，樓宇感覺這不是獎勵而是懲罰，自己的主戰機體被收走了，這讓樓宇十分難受。爲了彌補戰力空缺，回到公會格納庫的樓宇讓輔助職業幫忙改造力克·迪亞斯，並製造雷姆。
景澈被選爲msa-099力克·迪亞斯的駕駛者。orx-005加普蘭由錢塘公會的鬼王潮駕駛。論硬實力景澈更勝一籌，所以即使是面對屬性更加出色的orx-005加普蘭也是不落下風。
鬼王潮則是充分發揮了加普蘭可以隨意切換形態的特點，當景澈的力克·迪亞斯發出讓他無法躲避的攻擊時，鬼王潮就會把加普蘭變爲ma模式，用改變形態的方法和景澈周旋。
眼看就要命中的攻擊被景澈用匪夷所思的方式躲開後，景澈肝火大冒，抽出光束劍向着加普蘭砍去，鬼王潮發現景澈有些上頭，內心十分高興，兩塊可動式盾牌翼一夾，直接夾住了力克·迪亞斯拿着光束劍的手。景澈冷哼一聲，直接用另一隻手拿出專用光束手槍直接對準加普蘭的頭部。
加普蘭擰斷了力克·迪亞斯的手腕，力克·迪亞斯打爆了加普蘭的頭部。雙方各有損傷，但是誰都不服輸，景澈的力克·迪亞斯拿着專用光束手槍連點，鬼王潮的加普蘭也用腕部mega粒子炮還擊。力克·迪亞斯的視線良好，沒有被mega粒子炮打中，但是鬼王潮的加普蘭就需要小心翼翼地躲避力克·迪亞斯的槍線了。
二人打了一會兒互有優劣，戰鬥被重新拖入劇情。卡繆和夏亞因爲放心不下小林卡茲前來支援，作爲日後的情侶，卡繆的nt能力再次發動，精神力干擾到了村雨·鳳，也讓村雨·鳳感應到了卡繆的存在。爲日後二人的感情線留下了伏筆。
劇情任務草草結束，景澈和鬼王潮獲得了各自使用的機體，只要稍微修一下就能再次投入副本作戰。
隨着新型可變式機體的加入，官方再次更新設定，玩家在沒有多重職業證明的情況下，可以參加其他職業考覈，考覈完成後可以執掌其他職業崗位，但是沒有技能加成，職業等級也固定在見習級別。每個人的見習職業最多爲2個。這一設定有些雞肋，沒有技能加成的見習職業，戰鬥力十分有限，只能說是方便了那些駕駛可變型機體的機師罷了。
衆人還在研究系統新規的時候，世界公告響起：神龍公會晉升2級公會，獎勵公會特殊建築設計圖1張，格納庫佔地面積擴大，可建設附屬格納庫，公會成員上限150人。公會下屬小隊5支。
新的世界公告讓所有玩家議論紛紛，先前神龍公會勇奪公會戰月榜第一，公會經驗加了30%，第一個晉升2級公會理所應當，但是讓大家費解的是公會特殊建築設計圖又是什麼呢？