珂絲·帕拉雅的父親阿登納·帕拉亞是時任地球聯邦副部長，由於父母離異繼母又性格刁鑽，因此從小得不到家庭溫暖而變得性格叛逆激烈
阿登納·帕拉亞要求布萊度將戰艦開往side-1，爲的是和夏亞談判。阿登納與夏亞和談的目的就是新吉翁和平解除在甘泉的艦隊武裝，並將月神二號移交給聯邦當局。而作爲回報，夏亞將獲得阿克西斯作爲補償。當談判的進程令阿登納滿意後，阿登納前往月神二號監督新吉翁艦隊解除武裝。
阿姆羅在之前的戰鬥中意識到了夏亞機體的強大，將只開發了一半的rx-93n高達強行從阿納海姆開了出來。n高達由阿姆羅主導設計，但是卻加裝了夏亞故意透露的精神感應骨架技術，能夠最大限度發揮出他的newtype能力。
阿姆羅還修改了浮游炮的設計，增大了體積，並改爲長板型摺疊式，使用的時候兩邊摺疊起來利用磁場壓力產生光束攻擊。因爲全套浮游炮共六件並聯放置在機體揹包左部的武器架上，就像多了一隻翼，所以阿姆羅也將其定名爲“浮游飛翅炮”，終於擁有與夏亞的最新座機msn-04沙扎比相抗衡的實力。
得到新機體的阿姆羅心情十分愉悅，就帶着珂絲與哈薩維駕車兜風，在休息時段外出騎馬散步的夏亞和阿姆羅撞個正着。兩人大打出手，阿姆羅甚至拔槍欲向夏亞射擊，然而誰也沒想到就在此時珂絲竟突然奪去阿姆羅的槍械，並與夏亞一起由新吉恩軍的強化人邱尼駕機接走。
這一次，隆德·貝爾察覺到了危險，腐朽的地球聯邦一直想通過談判手段和新吉恩軍達成合作。但是在隆德·貝爾眼裏，這是不可能的，擁有獨立軍事權的隆德·貝爾。出現在了月神二號。
阿姆羅迫不及待的駕駛新機體出戰，rgz-91利·卡茲則是交到了樓宇手裏。夏亞用msn-04沙扎比對戰阿姆羅的rx-93n高達。這也是夏亞期待的，使用功能類似的機體進行公平之戰。既是宿敵也是戰友的兩人戰在了一起。
樓宇駕駛着利·卡茲尋找着nz-333a·瓦索龍的位置，但是被邱尼·卡斯的msn-03乍得·多加偷襲
乍得·多加的浮游炮艙莢盾襲來，樓宇和利·卡茲還在磨合階段。不能在第一時間有效反擊。樓宇只能豎盾抵擋。然後發射二連裝榴彈，干擾乍得·多加。
樓宇察覺到npc隨着時間線退移也變得越來越強了。不只是機體能力提升，npc的戰力也有大幅度提升。而且npc進入戰鬥就是滿狀態，玩家則是需要短暫預熱。
樓宇也體會到了阿姆羅迫切想要新機體的緣故。利·卡茲雖然有準塞可繆裝置生物傳感器，但是並沒有浮游炮這類的武器。樓宇的反應速度還達不到阿姆羅那個級別。被壓制的無法反擊，只能防守。
此時的另一隻鴨子正在陪着珂絲試駕新機體nz-333a·瓦索龍。作爲nt的珂絲雖然沒有實戰經驗，但是由於新吉恩軍缺兵少將，只能讓珂絲出戰。
在一旁的另一隻鴨子不知道怎麼幹預，只能和瓦索龍一起殺入地球聯邦軍陣營，然後目送珂絲怒殺親爹。
阿登納來到月神二號，才發現月神二號上的新吉翁艦隊大部分都是僞裝氣球假扮的，隨即阿登納所在的戰艦也參與到了對抗新吉恩軍的戰鬥中。
但是一臺巨大的機體出現。阿登納所在的戰艦下意識的攻擊這臺機體，被瓦索龍的i力場發生器擋住。受到攻擊的珂絲頓時失控，直接亮出了瓦索龍的所有武器。然後在不知情的情況下擊沉了自己父親所在的戰艦。已經覺醒了nt能力的珂絲，受到瓦索龍和父親死亡的雙重精神壓迫直接昏厥。
另一隻鴨子目睹了瓦索龍用了25秒就幹掉了一艘戰艦後，怎麼呼叫珂絲都無法得到回覆。另一隻鴨子只能開着ams-119基拉·多加將全高108.26米的瓦索龍。推回母艦。
相比於精英部隊的僵持不下，玩家部隊卻是一邊倒的局面。刺手玫瑰公會讓朱塔開着月亮高達大殺四方，同時也激發起了另一位王牌機師。蒼之死神加島勇的好勝心。
兩位機師如入無人之境，爲隆德·貝爾和地球聯邦殺出了一條路。此時吉恩軍已經沒有了這樣的王牌機師。只能讓列珍·施耐德和伊莉亞·帕佐姆兩名女性機師苦苦支撐。
雖然七月和流羽的組合技能爲吉恩軍制造出了一定的機會，但是在人數衆多的大混戰裏，顯得有些杯水車薪。
作爲主角，夏亞和阿姆羅一邊嘴炮一邊打架。阿姆羅使用浮游飛翅炮對抗夏亞的浮游感應炮。阿姆羅還意外地觸發了浮游飛翅炮的防禦模式，也就是放出粒子形成一道光束擾亂膜抵禦光束攻擊。
阿姆羅的nt能力本就凌駕於夏亞之上，不過夏亞的實力也是一直在進步，二者打的十分精彩，浮游炮的速度也越來越快。阿姆羅似乎喜歡上了使用浮游飛翅炮的防禦模式。連續擋下了夏亞的光束攻擊。
雖然主力們打的津津有味，但是吉恩軍的玩家們已經潰敗了。目前吉恩軍除了夏亞之外，最好的機師估計就是纔回到吉恩軍懷抱的真紅閃電喬尼·萊登了。
但是錢塘公會並沒有讓喬尼·萊登重回宇宙，而是留在地球和當初吉恩軍的另一位王牌機師白狼松永真鬥法。
正是因爲這樣導致了吉恩軍的潰敗，最離譜的還是加島勇開着一臺rgm-89傑剛就擁有了足以橫掃戰場的實力。不知道這位王牌機師會花落誰家。
被隆德·貝爾阻擊的新吉恩軍不得不撤退，不過好在夏亞的戰略目標並不是月神二號，而是小行星阿克西斯。
夏亞撤離之前，還對阿姆羅撂了一句狠話：阿姆羅，我們阿克西斯再見。