木星帝國的前身是負責運載木星氫3能源的木星船隊的根據地，也就是捷多-亞西塔工作的地方，木星帝國多次邀請捷多出山，但是捷多似乎看透了德拉克斯?德卡茲的扭曲人格，一直不同意加入木星帝國，爲此還遭到了德拉克斯?德卡茲的軟禁。
在U.C.0123年的宇宙巴比倫戰爭期間木星帝國假意向死亡先鋒投降，希望聯合死亡先鋒通過能源禁運來打擊地球聯邦；在戰爭結束後德拉克斯考慮到木星帝國早已能擺脫聯邦的統治自給自足，於是向地球聯邦提出了獨立的要求，但遭到聯邦的拒絕，爲了防止他自立大旗，地球聯邦通過政治婚姻安撫德拉克斯（也就是貝娜提·布里耶的母親）；經歷了快70年殘酷環境折磨的德拉克斯嫉妒地球圈的富饒，於是下定決心要毀滅地球，但是同時他也意識到只有幾個殖民衛星的木星帝國要向公然對抗聯邦簡直就是以卵擊石，因此他表面上歸順聯邦，通過交換生的方式換取地球聯邦的信任，背地裏偷偷的向地球輸送毒氣，並祕密發展軍事武器。
木星帝國的野心可謂是路人皆知，但是地球聯邦現在內亂不斷，軍力掌控地球圈都有些捉襟見肘，更別提管控距離更遠的木星了。
這時候心懷正義的貝拉-羅納站了出來，面對薩比尼帶着部分死亡先鋒成員加入木星帝國的局面，果斷收攏部下，組成了宇宙海盜來對抗木星帝國。
這也是劇情《機動戰士海盜高達》的劇情，劇情由神龍公會開啓。現在開啓劇情的環節基本上相當於一次隱藏任務，玩家們藉此搶佔先機。
故事的焦點集中在了一位名叫託比亞·阿羅納克斯的少年身上。託比亞是從地球圈前往木星圈的交換學生之一，但是在到達木星圈之際所乘坐的艦艇遭到宇宙海盜死亡先鋒的襲擊。
襲擊這艘交換艦的機體是海盜高達X1，機師是化名爲金凱度的西布克。
交換艦的周圍全是NPC的機體，死亡先鋒這邊以西布克爲核心，神龍公會爲主力開始清剿NPC機體。
隨着劇情的深入，玩家們可以自由使用自己的機體了，在一旁作戰的脆脆角很快就注意到了大秦龍魂周圍多了一臺新的機體PMX-004泰坦尼亞。
泰坦尼亞的機師是大秦龍魂的朋友鐵鍋燉月亮，之前一直在小公會發展，現在眼見大秦龍魂坐穩了神龍公會的主力，直接就前來投靠大秦龍魂。
夜龍王也不吝嗇直接就把新機體泰坦尼亞交給了鐵鍋燉月亮。大秦龍魂還調侃道：付羽，你小子面子夠大的，上來就拿到了這麼好的機體。
秦嬴直接說道：少拍馬屁，晚上燒烤你必須請。
小事，遊戲打爽了，喫啥都行。
鐵鍋燉月亮的泰坦尼亞和秦嬴的新機體e高達聯手發力，付羽的實力不在秦嬴之下。
泰坦尼亞的18枚浮游炮全部散了出去，頭部作爲主監視器的獨眼不斷搜尋着敵人的蹤影。
大秦龍魂的e高達來自於阿納海姆電子公司的廢案，原計劃該機體的核脈衝推進系統是通過小型的定向核爆炸來“推動”MS進行空間跨越，理論上講，通過這種系統所產生的推力將達到數百萬噸！這將令e高達擁有難以置信的運行範圍，和無與倫比的速度。
然而，在高達尼姆e合金的開發中，由於衝擊、輻射等嚴苛的要求，令E高達根本無法承受由這種推進系統帶來的反作用，最終該項目被認爲是失敗的產物而終止。
但是即使沒有核脈衝推進系統，該機體依舊是非常優秀的高機動型機體。
由於設計時需要讓E高達的武器能在超高速移動的同時使用，所以E高達的武器都是固定式的。
秦嬴和付羽相互配合，付羽將浮游炮排列好，開始猛烈輸出。秦嬴則是不斷遊走，但凡有接近的敵人都會被秦嬴消滅。
脆脆角暗自記下這一幕，然後就開始心安理得的划水。
亂戰之中，熱血少年託比亞找到了一臺傑剛，想也沒想就坐了上去。等到他衝出去的時候，站在他面前的正是西布克的海盜高達X1。
西布克本來想隨手解決掉這臺傑剛，但是託比亞鬼斧神工的躲過了西布克的攻擊。還順勢用光束步槍反擊，西布克急忙背身，用抗光束披風接下了這一發光束。
這一擊讓西布克燃起了興趣，直接掏出熱能短刀衝了上去，可惜的是託比亞除了靈光一現的反擊之外，整個就是一個萌新，被西布克三兩招輕鬆制服。帶回了母艦先鋒女王號。
很快戰鬥就結束了，交流生們都被帶到了先鋒女王號上，貝拉在戰艦上進行了演講。
揭露了木星帝國打算用交流生掩人耳目，並且祕密對地球實施侵略準備的事實，由於木星帝國內部現在有大量的死亡先鋒成員，所以貝拉的情報和信息都非常具有說服力。
貝拉拜託神龍公會將交流生們送回地球，讓這些交流生們去訴說木星帝國的陰謀，同時也是保護這些孩子遠離即將發生戰爭的木星。
但是知道了事情真相的託比亞，就如同他當初坐上傑剛參加戰鬥一樣，選擇了加上死亡先鋒，成爲對抗木星帝國的一員。
西布克覺得託比亞身上有一種一往無前的氣質，直接收託比亞爲徒。
機動戰士海盜高達的劇情正式拉開序幕。