原來在二代火影犧牲後，猿飛日斬成了三代火影，團藏、轉寢小春和水戶門炎成爲了木葉長老，秋道取風不爭權也不戀權便回到秋道家族教導後輩，而對於宇智波鏡，二代火影留下遺志要麼宇智波鏡回到宇智波家族平和宇智波一族或者是以祕密身份進入暗部守護着木葉。
原本宇智波鏡是選擇回到家族，但猿飛日斬不想錯過這麼一個高端戰力，勸說宇智波鏡讓他擔任自己的火影護衛隊，給出的理由是宇智波一族與村子關係緊張，宇智波鏡作爲唯一一個維繫兩者之間的紐帶，一旦宇智波鏡回到宇智波一族那麼之前宇智波鏡的所有努力都白費，木葉村與宇智波一族的關係就會急劇惡化。
在猿飛日斬的種種勸說之下宇智波鏡最終答應擔任火影護衛隊。在第二次忍界大戰中，宇智波鏡奉三代火影的命令去雨之國支援自來也、綱手、大蛇丸三人並帶去情報，讓其小心山椒魚半藏和千代的毒素。
可誰知在途中宇智波鏡竟遭遇伏擊，宇智波鏡不敵被毒暈，等到再次醒來就是在木葉的戰備醫院，聽說是志村團藏救下的宇智波鏡。但遺憾的是宇智波鏡的兩隻萬花筒寫輪眼被人挖去，傷養好後回到木葉，在猿飛日斬的安排下移植了一雙普通的寫輪眼並不在擔任火影護衛隊成員，而是以生前二代火影安排的祕密身份進入暗部，就這樣一步一步在自己的努力和猿飛日斬的幫助下成爲了那個神祕的暗部部長。
念休一開始聽到事情的原委猜測是志村團藏拿走了宇智波鏡的寫輪眼並且猿飛日斬知道，所以猿飛日斬纔會幫助一個宇智波人成爲暗部部長。現在暗部部長的身份曝光，宇智波鏡已經不再適合擔任暗部部長，在綱手的安排下一個神祕的新的暗部部長上任。
夜晚念休正在家中整理明天任務要的東西。上次綱手給自己安排的任務，因爲村子裏的各種事情的發生拖到現在才準備去完成。就在這時念休突然暈倒整個人趴在地板上，這時一個黑衣人推開門進來，看着地上的念休，黑衣人走到念休跟前立馬拿出一把苦無朝着念休刺去。
就在苦無快要刺中念休時，一隻手從從一旁突然出現抓住了黑衣人的手腕，接着那趴在地上的念休變成一團煙霧，念休一隻手打暈對方說道：“又抓到一個想害朕的人！讓我看看到底是誰！”
原來念休晚上一回到家救察覺到自己房間被人下來幻術，在念休的感知中這個幻術等級可以達到a級，但對於擁有萬花筒的念休來說根本不值的一提。念休倒要看看這麼晚了到底是誰這麼不長眼敢來他的家下幻術，於是將計就計終於等到對方現行，哪想到一個手刀就把對方打暈了。
念休用手掀開黑衣人的黑袍驚呼：“夕日紅！”看清來人是夕日一族的大小姐，念休心想：“自己應該和夕日一族無仇無怨吧！爲了給阿斯瑪報仇嗎？”也不看看自己有沒有那個實力，才一箇中忍就敢來刺殺一個超影高手，也不知道誰給她的勇氣，愛情的力量有這麼大嗎？
念休敲響了富嶽的大門，好一會里面才傳出富嶽威嚴的聲音：“進！”念休推門而入，才發現裏面不只富嶽一個人，宇智波美琴也在，念休還沒意識到問題和宇智波美琴打起了招呼：“族長夫人好！”美琴聽了後臉立馬紅了起來，然後快速離開了富嶽的辦公室。
富嶽見美琴離開纔開始問：“念休，這麼晚了還不休息，你明天不是還要出村去執行任務嗎？”
“族長，剛剛我在村子裏遭遇了刺殺。”
“什麼！是誰抓到了嗎？哪個憨批這麼大的膽子敢來宇智波族地刺殺天魔刀？”富嶽聽到還有人敢來刺殺念休也極爲震驚。
念休發現族長異常的激動想起剛剛的宇智波美琴，念休才知道自己犯了什麼錯誤，然後有些尷尬的說：“族長，人已經抓到了，是夕日紅。”
“夕日紅？”富嶽聽到這個名字想起村子裏傳言她在和阿斯瑪談戀愛便說：“難不成是因爲阿斯瑪？”
念休回答說：“也許吧！族長她被我打暈在房間，現在怎麼辦？”
“他敢刺殺我們宇智波一族的人，那就必須付出代價！當然是鬧得越大越好哦，要讓所有人都知道我們宇智波雖然這幾年收斂了氣性，但也不是好惹的！”宇智波富嶽霸氣的說。
於是就安排人去叫村子裏有頭有臉的人去念休的房子看看夕日紅的做法，一定要讓夕日一族給宇智波一族一個交代。
很快念休的院外就站滿了人，有綱手，有日向日足，有夕日真紅，有豬鹿蝶三族的族長等等。
看到人來的差不多了，念休站在宇智波富嶽身邊，就聽見宇智波富嶽高聲道：“各位，我們木葉最近可真是多事之秋啊！猿飛日斬的事剛剛解決，現在又有人開始針對宇智波念休了，還來在木葉刺殺念休，真是無法無天了！接下來各位就隨我一起看看這個賊人是誰！”
衆人走進念休的房間，可眼前的一幕可嚇壞了大家，怎麼會是這樣?不是說抓到了殺手嗎？
念休自己也被眼前的景象驚呆了，只見白和君麻呂，紅三人一絲不掛的躺在牀上。夕日真紅大怒：“我要這兩個小雜種死！”說着便朝牀上的白和君麻呂攻去。
念休知道自己這是中計了，便使用飛雷神攔住了夕日真紅，說道：“夕日族長這裏面一定有誤會！”
綱手迅速下令：“所有人都出去！”隨着一聲令下，衆人退出房間，只有夕日真紅、綱手、念休三人還留在屋內。