除了西南，明廷在東南方向也調集了包括曾名噪一時的浙江兵在內的援軍。然而萬曆四十八年五月，前往遼東的路上的石砫兵卻“至通州，偶與浙兵相觸格鬥”，雙方發生了激烈的械鬥，“情節起於片言之爭，兩兵殺傷未已也，而斃及民命矣。混搶行李未已也，而折及民房矣。炮聲與喊聲齊鳴幾至天地動搖，
城磚與瓦屋皆震”，幾乎演變成正兒八經作戰對陣，最後還是“地方官諭解旋止步”。
秦良玉當時甚至直接上疏萬曆帝，要求在原本三千白桿兵的基礎上，再調三千五百人去遼東，說的理由是“臣所將之兵止三千三十員，又自成一類，恐軍聲不甚振”，看得出，風俗習慣與他地不同的石砫兵在外省客戰期間因被孤立針對而滋生的自保之心。
朝廷視遼事爲重，爲避免節外生枝，萬曆帝並未將這件事擺上檯面走公審程序，而是以私人的名義下了口諭給涉事相關方，“以各兵爭鬥殺傷，領兵官鈐束何在，着聽地方官從公查理，仍各率衆星速赴遼。如再逗留生事，依議從重究治”，好歹把事情壓了下去。
石砫兵行事作風之兇悍，由是與強橫的戰鬥力齊名。
覃奇功說的不錯，川東、楚西南等地的土司兵皆亦官亦賊，縱然石砫歷任主掌者都懷家國忠義，但到底野性難馴根深蒂固，難以駕馭。這是一支軍隊的脾性或者說天性，控制這樣的軍隊，絕不可以暴制暴，需得懷柔，結其心爲主。
石砫兵人不多，但作戰能力有目共睹。覃奇功給王來興的建議是一定要拉攏石砫兵爲己所用。王來興幾次因爲石砫兵的無賴行爲觸怒，覃奇功都適時將他的怒火抿了下去，以免激化矛盾，一拍兩散。
這次戰事未了，石砫兵就與三譚的部隊打了起來，王來興的臉色陡變，覃奇功不待他發作，先問塘兵道“因何事起爭端”
塘兵回道“譚文因先進縣城者爲首功之令，搶先進縣城，把控了縣衙及倉儲、武庫等地，石砫兵隨後到，強要譚文讓出這些地方。譚文不肯，雙方一言不合即打了起來，譚詣見勢，也幫着譚文打石砫兵。而今有趙榮貴、馬寶兩部極力拉扯，尚不至於頭破血流。”
覃奇功點頭道“知道了，你回去告訴他們，就說總管即刻就到，自有公論。切莫再鬥，再鬥者不論事實如何，必以軍法論處。”
塘兵飛馬而去，王來興嘆道“想來馬萬年記着我允他的話，是以尋釁。”
覃奇功道“主帥之言一諾千金，既然答允了他，不可輕易反覆。”
王來興皺眉道“難道真要把城內讓給石砫兵劫掠”
“自然不是。”覃奇功輕輕搖頭，“馭石砫兵如馭虎，順毛捋猛虎方能化貓。總管若是不願再用石砫兵，這場仗完，打發他們回家即可。若是還要用他們，今日事，必須謹慎拿捏。”
王來興沉着臉道“實話說，今日之戰，若無石砫兵當先驅散獻賊，進展絕無如此順利。這是一把尖刀，有他們在軍中，對我軍的戰力幫助甚大。往後對決獻賊，戰事必然愈加激烈，還是得用他們。”
王來興對他素來服膺，點頭稱好。
轉瞬之間，兵馬已抵縣城。
馬寶早在城外翹首以盼，見到王來興，三兩步上來，殷切居前牽馬道“總管，你可算到了。”
“人呢”
“在縣衙前空地對峙。還好有趙大人居中調節，除了開始傷了三五個，別無大恙。”
“你怎麼在這兒”王來興看他一眼。
馬寶正立拱手道“獻賊尚未遠遁，仍有倒打一耙的可能。城內幾位大人有事纏身無暇外顧，屬下不敢怠慢，就在外圍戒備。”
“正是該當。”王來興聽他說得有理，點點頭，“前頭帶路。”
縣衙前的空地，相隔百步的左右兩端，左端一簇譚文與譚詣擁衆瞪向右端，右端一簇馬萬年與兩個表叔父也帶着人瞪向左端。空地當中，趙榮貴一個人一條凳，坐在那裏，隔住兩端。
“畜生”
譚文與譚詣眼尖，先迎過來，跟在王來興身後的譚弘惱怒，罵着給兩個兄弟一人一腳。
“總管，不是我倆犯渾，實在是石砫兵不講理”譚文哎呦哎呦揉着被踢中的大腿，臉上青一陣紫一陣，“總管說了，我等進兵解民於賊，進城先封府庫，不讓居心叵測的宵小有機可趁，我等都是謹遵軍令的”
覃奇功拍了拍齜牙咧嘴的譚弘，安撫他道“百姓之財不可劫奪，兩位做得好。”
譚文與譚詣聽了這話，壯了壯膽子，舉目而望，這時馬萬年一方也趕到了面前。
“我不講理是誰先動手的”馬萬年聽到了譚文的話，暴跳如雷。
“動手和下死手怎能想比你石砫兵一受阻，提着刀就竄上來，我的人能不動手自衛嗎你倒是瞅瞅，我的人那幾個，哪個不是見血了”譚詣不甘示弱，回敬道。
“那是你的人廢物，怪的了別人”馬萬年輕蔑道。
眼見雙方劍拔弩張的模樣又要打起來也似，覃奇功輕咳一聲，踏步而出，對馬萬年道“馬大人，能否借一步說話”
忠路覃家的名聲，馬萬年聽說過，也給覃奇功面子。他看着吹鬍子瞪眼的譚家兄弟，狠狠吐了口唾沫，轉身便隨覃奇功走出幾步。
“貴司與在下頗有淵源，早個十多年，雙方沒少走動。”覃奇功笑眯眯說道。
話是這麼說，但爲相鄰地區的強悍土司，忠路與石砫並不對付，真算起來，還是戰多於和，所謂“走動”，可想而知是什麼實情。不過馬萬年年紀小，忠路覃家尚未覆滅時，他還是個年幼無知的孩子，很多事其實也不清楚。忠路覃氏覆滅多年，秦良玉等長輩也很少刻意對馬萬年提他們，加之覃奇功現在身份顯赫，潛意識中馬萬年當然會覺得他說的都是實情。
“是，奶奶他也說覃先生是高士。”
“愧不敢當。”覃奇功笑了笑，“貴司的秦老夫人德高望重，纔是真正的國士無雙。”說到這裏，他發現馬萬年的情緒已經平復了不少，於是話鋒一轉，“據我所知，秦老夫人早年帶兵客戰，所經之處皆與民無犯，爲民歌頌。而今我軍剛將合江縣從獻賊手中救出來，馬大人就要劫奪庫房，恐非石砫的作風。”