當時隊中名將如雲，由防守的科曼、拉塞爾以至進攻的羅馬裏奧、薩博尼斯，可謂粒粒皆星。唯一美中不足之處，是球隊在1994年歐冠決賽以零比四的大比分慘敗於卡佩羅執教的AC米蘭，無法再取得另一個歐冠冠軍。
隨後幾年巴薩成績一直平平無奇，但當球隊在1997年夏天由荷蘭人範加爾接手後，球隊便先後贏得1998及1999年聯賽冠軍。當時範加爾大量引進荷蘭球員，由防守的科庫以至前鋒的克魯依維特、範·方卓都是星級荷蘭人，被稱爲「荷蘭班底」。可惜範加爾並未能爲球會更進一步，起因源於範加爾與球員就戰術問題不斷爭執，影響球隊士氣。而與部分球星不和亦令範加爾對球員甚有微言。當在2000年西甲中型班拉科魯尼亞贏得西甲冠軍後，巴薩只得第二名，範加爾便宣佈辭職，更在記者會上抨擊球員毫無素質，沒有能力爭取佳績，自此巴薩踏入衰落期，聯賽更曾一度跌落至第十五位，連歐冠杯席位都多次失去。
一衆巴塞羅那球員一起合照2003年夏天巴薩大改革，拉波爾塔成爲俱樂部主席，聘請了荷蘭人裏傑卡爾德來到俱樂部出任主教練，並收購了巴西超級球星羅納爾迪尼奧，這標誌巴塞羅那的復興。先於2003至04年球季反彈至第二名，待德科、埃託奧、久利、拉爾森等名將加盟，巴塞更連續兩屆贏得聯賽冠軍。
2006年巴塞羅那更是在歐洲冠軍盃決賽中擊敗對手阿森納，繼1992年後第二次奪得該項錦標，但隨着更衣室矛盾的一步步升級，巴薩在接下來的兩個賽季裏一冠未得，夢二王朝在更衣室的漩渦中越陷越深。
2008年夏裏傑卡爾德離任，曾經的諾坎普國王瓜迪奧拉走馬上任，爲了緩解更衣室的矛盾，巴薩果斷地送走了夢二王朝的核心小羅和德科，提拔了年僅二十一歲的梅西作爲新的核心。重視青訓營一直是瓜帥的特色，在拉瑪西亞青訓營裏，瓜帥一舉提攜了布斯克茨、佩德羅以及召回在曼聯不得志的皮克等青訓小將，並鞏固了伊涅斯塔的主力位置，而這也爲巴薩的復興奠定了基礎。在08-09賽季巴薩在瓜迪奧拉的帶領下獲得了聯賽冠軍、歐洲冠軍和國王杯冠軍，並在09-10賽季前半段（2009年）又獲得了歐洲超級盃賽、西班牙超級盃和世俱杯，在09年獲得了史無前例的六冠王稱號，這也標誌着巴薩夢三王朝的誕生。
2011年5月29日2010/11賽季歐洲足球冠軍聯賽決賽在溫布利大球場展開角逐，巴塞羅那三比一取勝曼聯，佩德羅先拔頭籌，魯尼一度扳平比分，梅西和比利亞隨後破門，巴薩三年內二度取勝曼聯，兩奪歐冠冠軍，歷史上第四次奪得歐冠。
自巴薩成立之日起，俱樂部就有自己的隊徽。球隊成立初期採用的是巴塞羅那市的市徽，只不過他們在市徽上又加上了象徵冠軍的月桂花冠以及一隻蝙蝠，在圖案的周圍寫上了俱樂部的名稱和成立日期。
在1910年的時候，巴塞羅那隊舉辦設計隊徽公開競賽，卡洛斯·科馬馬拉成爲俱樂部會徽設計者，他爲巴薩設計了沿用至今的隊徽。隊徽類似鍋，後來人們認爲在俱樂部隊徽上應該加入一些象徵着加泰羅尼亞地區的標誌，於是就加入了黃紅條紋；在隊徽的左上邊人們還加入了巴塞羅那的守護神聖秋帝的十字架以象徵巴塞羅那城；隊徽下面的藍色和紅色間條是象徵着俱樂部的顏色，最後在紅藍條紋之間又加上了足球。1910年之後，隊徽設計改動很少。1949年俱樂部50週年慶典時，右上角的深色條紋恢復；1974年，隊徽基本恢復到1910年的設計。2002年，新的隊徽面世，由設計師塞拉伊馬設計，他取消了F.C.B.中間的點以及側面的數字，風格更簡潔、明快。
2018年9月28日，發佈球隊全新隊徽，擁有現代風格的新隊徽有望於2019/20賽季正式啓用。與此前的隊徽相比，新隊徽中去除了“FCB”字樣，隊徽下方的紅藍兩色條紋比以往更寬，並且顏色較老隊徽更鮮亮。此外，隊徽中的足球位置也更靠近中心位置。足球俱樂部此次推出全新隊徽是爲了更好地適應時代潮流，球隊當前使用的隊徽是2002年開始啓用，從那時到現在，社會與科技都發生了巨大的變化，因此球隊隊徽也應當與時俱進。此外，新隊徽能夠更好地適應當下的新媒體潮流，從而提升巴薩的國際化並更好地推動巴薩的品牌戰略。