這場改革，是以行政改革爲首，所有出自於經商家庭的官員一律清退，同時朝廷從中央空降一大批官員、公務員下來，然後再派出中央軍使這批到任的改革官員擁有足夠強硬的暴力機器。
到任後，又組織建設當地的武警、公安。
同時將各個地方部門建立起來，不再如同過去那樣只有一個衙門，經過多年改革之後，改革後的地方行政體系已經有了十多個部門，這些部門各司其職、權責明確，哪裏出了問題找哪個部門麻煩。
行政改革完成後，地方上的新政府要做的第一件事就是改革稅收，改革之後沒有什麼免稅特權一說了。收稅前要做的就是登記工商、丈量田畝。
所有從事經營活動的商人，除了那些小攤販之外，全都要到工商局登記註冊，工商局發給營業執照，朱由校也下旨各地改革地區，工商局必須以最快效率給商人提供登記、註冊，不能出現懶政現象。
經營規模達到一定規模的，則是必須成立公司。
完成工商登記的工商從業者，必須依法納稅。一個是商品增值稅，一個是消費稅，還有營業稅、企業所得稅、個人所得稅、資源稅、城鎮土地使用稅、房產稅、城市維護建設稅、耕地佔用稅、土地增值稅、車輛購置稅、車船稅、印花稅、契稅、菸葉稅、關稅、船舶噸稅、奢侈品稅等稅種。
同時還有一個農業稅，則是需要進行丈量田畝來清算。
加上丈量田畝，這是一個比較龐大的工作量，工商登記之後要到處催科收稅，但是很多商人就是不交，其他商人一看別人都不交，他們也不交，收稅的公務人員上門催也沒用，商人都是拉着臉說沒錢。
官府催上幾次沒用，只能使用暴力機器了，讓公安、武警拿人，不是沒錢麼？到大牢裏先待着。
還沒錢？
那就抄家了，真要是沒錢的話就把人放了。要是查抄出來的資產比徵稅的還要多，那就直接充公了。
一羣商人被逮進大牢，很多都被嚇尿了，連滾帶爬的把稅給交了。
那些商人倒是比較容易解決，都是一些生意人，沒有什麼羣衆基礎，而且多數都是在城裏，官府要拿人什麼的也容易，隨便出動暴力機器就能把他們嚇尿，接下來就只能乖乖交稅了。
更麻煩的實際上是丈量田畝和徵收農業稅。
丈量田畝的時候就有大量的民間糾紛，過去很多農戶爲了逃避稅負，將地契投效給了那些能夠免稅的舉人、進士，不過那些地契都是白契，在官府是沒有備案的玩意。
農業稅改革之後，南方地區耕地面積少於30畝的農戶是完全免稅的，而北方則是50畝，東北氣候寒冷的地區則是300畝。
在南方地區，即便是耕地達到300畝的地主，農業稅也只有10%，朱由校對那些地主，實際上也是給活路的，特別是那些中小地主。以大明當前的農業生產力，雖然已經出現了很多農用機械，但自動化農業機械還是沒有的，所以生產力還沒有達到一個人就能耕種上千畝土地的程度，所以朱由校制定的農業稅正好把紅線劃在300畝這個界限，這就足夠一些個人家庭使用農業機械進行耕作了，不會造成土地不夠發揮一個人的勞動力的問題，甚至300畝土地在當前還是有些過多。
各地新政府一方面要解決這樣的民間糾紛，一方面則是對農業稅展開徵收。
對於這些民間契約的糾紛，朝廷的政策出發點就是遏制土地兼併，所以那些沒有在官府報備過的白契一律無效，土地判歸自耕農。
所有土地在農業稅改革後，都要重做地契。
土地面積都要丈量得一清二楚，地方上的新政府在丈量田畝上面就花了九牛二虎之力，工作量實在有點大，不過工作量再大，也要一天接一天的幹，直到把活幹完爲止。
一些地主豪強爲了抗稅，阻撓田畝丈量，甚至打傷公務員。這簡直就是在捅馬蜂窩，官府直接把武警派去拿人，扣上一個暴力抗法的帽子直接丟進大牢，然後土地丈量繼續展開。
這些地主豪強進了大牢，事情就沒那麼簡單了。敢做出暴力抗法的事兒，絕對不是良民，處理起來也很嚴厲，基本上都是沒收土地、勞動改造。沒收到的土地，則進行拍賣出售。
有些甚至是整個宗族進行暴力抗法，依託村落的防禦工事抵抗武警，結果中央軍把火炮拉來了，幾炮下去就把土牆、寨門給轟開了，然後整個宗族都被逮進去了，全部進行勞動改造，普通的宗族成員勞改幾個月放了，主謀則是繼續勞改。
土地丈量和農業稅的徵收，都在武警、公安和中央軍的配合下，強力的掃清了各種障礙，真可謂是民心似鐵、官法如爐。
然而這次改革是深受普通百姓擁戴的，那些地主商人還有權貴們想要造反，顯然缺乏羣衆基礎，真正的民心還是站在朝廷這邊的，那些試圖反抗改革保住利益的羣體，只是部分民心而已。
過程中一些行爲惡劣的羣體，也被地方政府報告朝廷，然後在秋後進行斬首示衆。
一時間也是殺得人頭滾滾，那些權貴和地主豪強，以及那些商人幾乎被嚇破膽。誰敢阻擋這次改革的滾滾大勢，誰就要付出代價。
隨着改革的進行，普通老百姓根本不聽那些資本階級走狗的文人忽悠了，因爲朝廷改革之後，對於普通老百姓來說，減輕了大量的負擔。
徭役不徵了，自耕農免稅了，同時鹽稅也減輕了。同時朝廷還搞了減息降租，土地佃租一律不得超過一成，而在民間借貸方面，規定月息不能超過8釐，過去簽下的借貸契約一律整改，碰上不整改的可以到法院訴狀。
改革之後則不允許民間借貸的利息超過8釐的月息，否則一律視之爲高利貸，將受到法律的制裁。
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nbsp;不管是自耕農還是佃農，在改革之後日子都好過了許多。
而且每個施行改革的地區，法院都運轉了起來，老百姓來訴訟也都認真對待，法政人員都是朝廷派來的，在制度監督之下也不敢玩收受賄賂，盡到了保護弱勢羣體的責任，能夠及時的處理訴訟，也能給出一個公正的判決，一時間也讓老百姓拍手稱快。