不日，曾國藩裁湘軍、建滿營、籌科舉奏摺至京。慈禧太后觀覽，嘆曰：功成，名遂，身退，孰人做的？曾卿國藩，真乃完人也。
恭親王奕忻道：啓稟皇太后，曾國藩、李鴻章、左宗棠三部，已近十餘萬衆；裁撤三四萬人，以節靡費。金陵已得，粵逆大部已滅，李鴻章、左宗棠二部，剿滅餘匪，綽綽有餘。
慈禧太后道：粵逆既滅，湘勇即撤，先皇早已界定。然一呼即應，或有卸磨殺驢之嫌。速傳上諭，江南匪患未息，浙江巡撫曾國荃務必督率湘勇，再接再厲，剿殺餘孽，再立功勳。
奕忻道：曾、李、左皆乃一系，曾左奏章先後而至，是否已經互通款曲？
慈禧太后道：江浙滬毗連一體，曾、李、左互通款曲，亦屬常情。左宗棠發此奏摺，曾國藩不加攔阻，左部似以獨軍而立。此之於.大.清，天大之喜事。左臣之奏摺，務必轉至金陵傳閱。
慈禧太后言罷，即敕軍機處，再傳上諭：曾臣國藩，裁撤兵勇，雖爲節餉起見，然驟撤三四萬人，恐此輩久在戎行，不能省事，必至隨處嘯聚爲亂。
從川、楚善後，積至數年，方始肅清，可爲殷鑑。不若先汰老弱，而以精壯各軍分赴江、楚，俟江、楚一律肅清，再議裁撤歸農，或挑補各營兵額，使不致復生枝節，方爲盡善。
曾國藩、曾國荃觀左宗棠奏摺，皆怒，復擬疏文曰：七月二十四五日，臣在舟次，迭奉七月十一、十四、十五等日寄諭，訓飭之事甚多，而遣散勇丁及查僞幼主下落二事，尤屬迫切。
湘勇招募之初，選擇鄉里農民，有業者多，無根者少，但使欠餉有着，當可安靜回籍，不致別生枝節。
至挑補兵額之說，近多建此議者，臣竊不以爲然。蓋勇丁之口糧，一倍於馬兵，三倍於守兵，馬糧之缺極少，守糧月支一兩，斷不足供衣食之需。誰肯於數千裏之外，補一衣食不敷之缺？
欲以湖南樸實之勇，補三江綠營之兵，必不情願。其願補者，皆懶惰無家可歸者也。臣愚以爲勇則遣回原籍，兵則另募土著，各返本而復始，庶爲經久可行之道。
另，金陵城破，僅逸出數百人，僞幼主以十六歲年紀，縱未斃於烈火，亦必死於亂軍，當無疑議。
曾國荃觀文，曰：此疏文口氣之強硬，兄長真乃東南之主也！
曾國藩道：左宗棠自謂氣候已成，金雞獨立矣！沅弟浴血兩載，方克此堅城；此功之巨，無人可撼！左宗棠以僞幼主名，道三言四，實屬自討無趣。只因金陵銀盡，吾等一再退讓，退避三舍，是爲以退爲進，討人歡心。兩宮倘若再行威逼，軍即不裁，擁兵自保，孰能奈何？
曾國荃道：兄長疏文如此之剛直犯上，兩宮倘若用強，該當如何？
曾國藩道：一張一弛，立身之本。爲一未成氣候之幼主，兩宮毋須用強；調撥反間、分崩離析吾十萬之湘軍，方是兩宮孜孜之必求。如無意外，裁軍諭旨，近日即至。弟可未雨綢繆，先行試裁；吾即去安慶，了卻諸事，月初即可回返金陵。
慈禧太后接奏，欣喜無比，復敕軍機，將曾國藩摺子，抄傳杭州。又諭：曾臣國藩，所奏裁軍、築營、開科三事，着即實施；曾臣國荃，秣馬厲兵兩載，克復金陵，功績卓越。然經年戎馬，曾臣國荃恙病纏身，急於求退；朕再三思量，著即允准；着送曾臣六兩人蔘，慢服常飲，以杜頑疾。
曾國荃接旨，大罵三日。
左宗棠閱曾國藩奏摺，亦罵不止，復又奏曰：曾國藩雲杭賊全數出竄，未聞糾參，尤不可解。金陵早已合圍，而杭、餘則未能合圍也。金陵報殺賊淨盡，杭州報首逆實已竄出也。
臣欲糾參，亦烏得而糾參之乎？
至若廣德有賊不攻，寧國無賊不守，致各大股賊逆往來自如，毫無阻遏。臣屢以爲言，而曾國藩漠然不復介意。
前因幼逆漏出，臣復商請調兵以攻廣德，或因厭其絮聒，遂激爲此論，亦未可知。臣子上疏，論議國事，自以爲常，然因意見之弊遂發爲欺誣之詞，似猶未可。
臣因軍事最尚實質，故不得不辨。至此後公事，均仍和衷商辦，臣斷不敢稍存意見，自重愆尤。