兩宮太后接奏，研磨三日，無果，遂召諸臣廷議。
慈禧太后道：李鴻章惟新疆不復，於肢體之元氣無傷；海疆不防，則腹心之大患愈棘；李欲棄塞防而專海防。左宗棠東則海防，西則塞防；左意塞、海並重。此已論爭半載，久而不決，貽害無窮，衆大人何意？
軍機大臣文祥道：我朝定鼎燕都，蒙部環衛北方，百數十年無烽燧之警，是故重新疆者所以保蒙古；保蒙古者，所以衛京師。懇請皇太后、皇上勿棄西陲邊塞。
恭親王奕訢道：祖宗之地不可棄而弗圖，奴才懇請皇太后、皇上一視同仁。
慈禧太后道：左宗棠東戡閩越，西定關隴，以戰則克，以守則固，放眼華夏，才無出其右者。速諭內閣，特命陝甘總督左宗棠爲欽差大臣，督辦西征新疆軍務；原烏里雅蘇臺將軍金順爲烏魯木齊都統，幫辦新疆軍務；原烏魯木齊都統景廉憂勤致疾，原西征糧運幫辦袁保恆積勞成疾，特許二人回京述職。陝西布政司譚鍾麟，護理巡撫期間，興義學，立書局，疏浚渠，勞苦功高，著實授陝西巡撫。
左宗棠接旨，不喜反憂，覆上疏曰：臣現整旅出征，應用火器、子藥、皮棉衣褲、氈包棚帳、騾駝馬匹、採買、製造、轉運諸費，每款動需數萬十數萬。
汰遣弁丁，應清欠餉，添募精壯，應增正餉，出塞征夫，除食糧照章核扣正餉外，餘餉均需現銀實發。
南北各路糧運，九月後愈加暢旺，駝馬、車騾、人夫、牲畜各數萬計，腳價薪糧均需現發；口袋、氈條、車駝、酌帶什物須隨時添置。
茲因年節，屆時應發滿餉一月，各營將弁兵勇盼望甚殷。出關馬、步各營，已調赴涼州各隊待餉進發，各路糧運腳價待銀應付，稟牘紛來，急如星火，臣無以應也……
宗棠奏罷，急召西寧道劉錦棠，道：吾年衰病久，深虞精力未足符其志；毅齋英銳果敏，謀而能斷，才氣無雙，吾欲爾總理行營事務，統率中軍，會合金順、張曜、金順昌部，先戰北疆，如何？
劉錦棠道：左帥統籌全局，錦棠雖萬死不辭！啓稟左帥，新疆諸城距關隴，近者千里，最遠之喀什，六千里之遙；錦棠不慮軍機之遲鈍，而憂餉事之艱難。
左宗棠道；惟整軍乃可經武，附以能統之將，復加實心任事之人，西征之事成矣！毅齋勿慮，千斤重任，萬千諸事，老夫可承且擔。辦理出關諸軍餉數及糧運情形摺子已四百里加急奏出，朝廷餉銀湊出，大軍即可誓師西征。
宗棠笑曰：幕客亦耗餉銀也，老夫亦乃師爺矣！虞紹南公負氣而走，劉克庵公不日即至，左某絕不妄花一個銅板。營兵裁撤及善後事宜，可否順遂？
劉錦棠道：啓稟左帥，還算順利。穆圖善與文麟部，全部遣散；成祿部，裁至三營；金順、景廉二部九十餘營，裁至四十營；老湘軍、徐佔彪果勇營、張曜嵩武軍、金順昌卓勝營四部一百八十餘營，已裁至一百四十營。
左宗棠道：多矣多矣！傳吾軍令，金順八旗部，務必再裁二十營；老湘軍、果勇營、嵩武軍、卓勝營四部，務必再裁四十營。入疆大軍，務超一百二十營。一百二十營大軍，將士、伕役八萬餘，征戰新疆曠遠之地，每歲尚耗銀一千萬兩；如此巨銀，帑將安出？生平以用餉爲憂，以爭餉爲恥，然若不爭，焉得西陲！
1876年1月，宗棠再奏；奏爲遵旨整軍出關，餉源涸竭，擬籌鉅款，權濟急需，恭折馳陳，仰祈聖鑑事。
塞外用兵，糧運、屯墾耗費頗多，而各省、關應協西餉日益減少。關隴貧瘠情形屈指可數，就地無處籌餉，所以專盼各省厘金接濟，而各省厘金大部又均用於海防。
竊臣上年遵旨裁併，留馬步一百四十一營。嗣撤穆圖善所留步隊四營半，零星資遣，仍存馬步一百三十餘營。每歲需實餉六百餘萬兩，復加西征糧運二百萬兩，通計一年出款共需實銀八百數十萬兩，經臣據實陳奏在案。
合無仰懇天恩，俯念邊塞軍務緊要，餉源枯竭，待用方殷，敕下戶部、各省疆臣，速將部撥出關糧運專款內短解銀一百四十餘萬兩限期提解；所有積欠甘餉兩千六百一十餘萬兩，分省分限指提若干，應解提餉仍按月如數提解，毋再拖延，俾速戎機。
兩宮接奏，即諭：加恩着於戶部庫存四成洋稅項下撥給銀二百萬兩，並準其借用洋款五百萬兩，各省應解西征協餉提前撥解三百萬兩，以足一千萬兩之數。該督得此鉅款，務將新疆軍務早日蕆事，迅奏膚功。
各省疆臣，自本年爲始，月清月款，不準絲毫再有拖欠。如再嚴飭短解，即由左宗棠、譚鍾麟分別指名參奏。
左宗棠接旨，跪誦再三，老淚縱橫。