由於荷蘭人的駐軍數量並不多，依附荷蘭人的土著戰鬥力十分有限。
這次收復臺灣之戰，朱琳澤也沒必要傾盡全力，將福建地區的主力全部都派遣到臺澎地區作戰。
此戰朱琳澤只打算調遣兩標新軍，再從鄭芝龍舊部中挑選一萬精銳入臺澎作戰。
至於左良玉舊部，由於左良玉舊部不善於水戰，在船上站都站不穩，就算帶了也不能發揮出多大的作用，反而會給他添麻煩。
朱琳澤遂決定讓金聲桓帶着左良玉舊部和一標行軍留鎮閩南，並抽出部分兵力和黃得功一起入粵。
鄭芝龍勢窮在和紅夷達成合作協議之時，就等同於將臺澎地區的控制權拱手相讓。
這在民間激起了強烈的憤慨，閩臺兩地的民衆血脈相連，將臺灣讓給紅夷，無疑是讓兩岸的同胞骨肉分離。
此番朱琳澤決定出兵臺灣，驅逐紅夷，解救苦難同胞之舉得到了當地民衆的熱烈擁護。
因而所需物資籌措起來非常方便，出兵的日期甚至還比原定時間提前了五天。
朱琳澤出兵臺灣，聲勢浩大，想要瞞住荷蘭東印度公司是不可能。
遊曳在臺灣海峽之間的荷蘭東印度公司船隻很快得到了這個消息，並將消息迅速告知安東尼·範·迪門。
安東尼·範·迪門在獲悉這個消息內心惴惴不安，他從未如此緊張過。
荷蘭東印度公司在遠東的艦隊已經被明帝國艦隊重創，鄭芝龍集團覆滅，他又失去了一個重要的合作伙伴。
現在他只能隻身面對強大的明帝國艦隊。荷蘭東印度公司引以爲傲的海上優勢，此時在龐大的明帝國面前蕩然無存。
而陸地作戰，對方則有數量龐大的軍隊，後備兵源更是源源不斷。安東尼·範·迪門對陸戰也毫無勝算。
荷蘭相較於大明實在是太過渺小了，荷蘭本土的人口甚至還沒有大明朝的一個福建多。和對方拼消耗肯定是拼不過的。
眼下安東尼·範·迪門唯一可以依仗的便是熱蘭遮城這座堅城要塞。
安東尼·範·迪門很快做出了兵力部署，除了澎湖留兵駐守，以屏護熱蘭遮城之外。臺南其他地區的兵力全部撤到熱蘭遮城內，同時抓緊時間囤積糧草物資，做好了長期固守熱蘭遮城的打算。
安東尼·範·迪門還想將雞籠淡水兩地的兵員調到熱蘭遮城，放棄雞籠、淡水這兩個食之無味，棄之可惜的港口。只是爲時已晚，雞籠和淡水兩地此時已經被竹塹的明軍包圍。
雞籠和淡水兵力十分單薄，難以久守，竹塹的明軍包圍了雞籠和淡水，佔領雞籠和淡水也只是時間問題。
據安東尼·範·迪門所知，明帝國內部此時也是矛盾重重，北方的韃靼甚至佔據了明帝國北部的半壁江山，只要他堅守的足夠久，就有希望堅持到對方退兵，以保住荷蘭東印度公司在臺灣地區的利益。
除了做好堅守的準備之外，安東尼·範·迪門還讓福爾摩薩總督卡隆準備厚禮，前往拜謁朱琳澤。
要是能用錢解決福爾摩薩地區的問題，那自然是再好不過，能用錢解決的問題都不是問題。
卡隆作爲荷蘭東印度公司的談判代表前來和朱琳澤談判。
卡隆向朱琳澤提出了荷蘭東印度公司開出的條件，荷蘭東印度公司願意撤出雞籠和淡水，並願意支付白銀一百萬兩用於購買臺南和澎湖地區的費用。
只要明軍撤走，並和荷蘭東印度公司簽署停戰協議，荷蘭東印度公司馬上支付一百萬兩白銀。
朱琳澤只是覺得荷蘭東印度公司所開出的條件非常可笑。
雞籠和淡水兩地，他已經是唾手可得，用得着荷蘭人讓給他？
至於一百萬兩白銀贖買臺澎，那更是無稽之談，荒唐至極。
不要說這些年建設竹塹所投入的銀子不止這個數，就連開發較晚的崖州，朱琳澤所投入的白銀也遠不止一百萬兩白銀之數。
荷蘭東印度公司這是低估了臺澎地區在朱琳澤心中的分量，不要說一百萬兩白銀，就算是荷蘭人願意出一千萬兩白銀，朱琳澤也不會和荷蘭人簽署這紙合約，大明可不是大清。
“要是國王陛下覺得這個價錢不合適，我們還可以談。”卡隆見朱琳澤不爲所動，急忙說道。
“孤願意出一百零一萬兩買阿姆斯特丹，你們荷蘭人會賣嗎？”朱琳澤義正嚴詞地喝斥道，“主權是無價的，豈容買賣？！”
“那國王陛下想要什麼？”卡隆非常失落地說道，看來想要通過談判來解決臺澎問題的希望已經十分渺茫了。
“荷蘭東印度公司的相關人員盡數撤出臺灣，也就是你們口中的福爾摩薩。”朱琳澤扣着桌子說道，“你們如果願意主動撤出臺灣和澎湖，孤可以讓你們體體面面地走，要是不願意，孤的軍隊就幫你們體面。”
眼見談判無望，卡隆只得告辭，回熱蘭遮城將這個絕望的消息告知安東尼·範·迪門。
安東尼·範·迪門對此早有心理準備，已經做好了堅守熱蘭遮城的打算。
荷蘭東印度公司駐守澎湖的中堅力量只有五百名東印度公司的僱員，除此之外島上還有三千多名鄭軍舊部。
朱琳澤讓甘輝和洪旭出面收復澎湖列島，鄭軍將士見是自己的老上官前來，加上他們本來就不想爲紅夷賣命，只是他們的家人都在大員等地被紅夷人控制，這纔不得不爲賊賣命。
澎湖列島上的鄭軍舊部配合甘輝、洪旭裏應外合，控制住了澎湖列島上的五百名紅夷兵。
朱琳澤在只復出微不足道的傷亡下便順利收復了澎湖地區，進而直進軍臺南地區。
臺南地區的漢人村寨聽說明軍來了，紛紛舉旗歸附，轉瞬之間，偌大的臺南地區只有一座小小的熱蘭遮城依舊在荷蘭東印度公司的控制之下。
朱琳澤令大軍迅速包圍了熱蘭遮城，此時的熱蘭遮城城內尚有兩千出頭的紅夷兵，三千多名藩兵以兩千多名漢兵。剩下的則是這些漢兵的家眷。
很快，竹塹兵工廠的24磅炮也運抵了大員地區，正在港口進行吊裝。
除了24磅炮，這次兵工廠還給了朱琳澤一個大大的驚喜，那就是他們已經成功試製了32磅炮，這次也隨24磅一起將剛剛試製完成的十門32磅炮運抵熱蘭遮城進行實戰實驗。