各地分置五十九兵馬府行營，兵馬府內置都帥一名，總領兵馬府區劃內的兵事，包括將校任免、興兵討逆、緝捕盜賊等。
河東兵馬府，都帥李克用。
轄區爲除雲州、河中以外（這兩地本就不在李克用的掌控下）的所有河東道屬地,包括晉陽、汾、沁、遼、嵐、石、忻、代、朔、蔚、澤、潞等十二個州府。
其中潞、澤二州本爲昭義軍領地，爲李克用強奪，朝廷同意了李克用所奏請的二州刺史人選，但並未將其劃歸河東軍領地。而此次的兵馬府行營區劃中，直接將這二州劃歸河東兵馬府，明顯是存了示好之意。
汴宋兵馬府，都帥朱全忠，
轄汴、宋、亳、潁、滑、鄭六州。
其中，汴、宋、亳、潁四州爲朱全忠的宣武鎮領地，滑、鄭二州奪自義成軍，朝廷也早承認了朱全忠的佔領。
其實，河陽鎮所領的東都洛陽、懷州、汝州也已爲朱全忠實際佔領，但朝廷卻另置河陽兵馬府，另任張全義爲都帥。當然這一點還可以強行解釋，畢竟張全義還住在洛陽城裏。
但以下幾處便將朝廷的意圖顯露無疑。
陝、虢二州已實際爲朱全忠佔據，朝廷將其劃歸河中兵馬府。
曹、濮二州本天平軍朱瑄領地，已被朱全忠搶佔，可朝廷再次將其劃歸鉅野兵馬府（天平軍領地內標誌性地理爲鉅野澤）。
淮西之地除陳州外，其餘許、蔡二州已被朱全忠佔有，朝廷卻再次設立淮西兵馬府。
還有朱全忠從時溥手裏搶來的豐縣、蕭縣等地，也全還給了時溥的徐泗兵馬府……
若再與李克用的河東兵馬府能全領實際據有之地，除非朱全忠失了智，否則一定能看出朝廷打壓他的意圖。
當然，朝廷如此劃分只能說是心不公，但卻並沒有違制。
雖然朝廷不斷地給朱全忠封爵，從沛郡侯到沛郡王，再改封吳興郡王,再進封東平王……但他所領職務始終是宣武軍節度使，而宣武軍的鎮地，也一直是汴、宋、亳、潁四州。
……
其餘各地行營，也均秉承拉一踩一的策略。
河北地區。
有盧龍節度使李匡威、成德節度使王鎔、義武節度使王處直、平盧節度使王師範、魏博節度使羅弘信、義昌節度使盧彥威。
考慮到李匡威勢力最大，朝廷選擇拉的是王鎔和羅弘信，踩的是李匡威，其餘三位節帥不拉不踩，讓其管控現有領地兵事。
……
淮南地區。
自高駢死後，整個淮南、兩浙一帶陷於了長期混戰，各路藩帥輪番廝殺。
至此時，秦彥、畢師鐸、高霸、趙鍠、薛朗等老牌藩帥已被逐個淘汰，餘下的主要勢力有孫儒、楊行密、田頵、董昌、錢鏐、張雄等。
其中，楊行密和田頵同屬“三十六英雄”，當朝詩人韋莊曾言“南朝三十六英雄，角逐興亡盡此中”，就預言了淮南政權，最終會落入楊行密爲首的這個三十六英雄團體。也就是說，楊行密與田頵目前處於合作共事階段,可歸爲同一勢力。
餘下張雄只據有上元（今南京）一帶，勢力薄弱。
最後，朝廷選擇拉董昌、錢鏐和張雄，踩向來殘暴的孫儒和正迅速崛起、大有統一淮南之勢的楊行密、田頵。
……
荊襄地區。
趙匡凝兄弟一家獨大。
其餘荊南成汭、澧朗雷滿、黔北王建肇、鄂嶽杜洪、黃州吳討等，都無法與雄踞山南東道七州的趙家兄弟抗衡。
按照朝廷設置兵馬府乃爲遏制地方強藩的意圖，當削減趙家兄弟的領地纔是。至少也當將山南東道七州拆分成兩個兵馬府，由趙匡凝、趙匡明兄弟各領一府都帥，從而挑起兩兄弟之間的爭奪。
然而考慮到趙匡凝一貫忠心，可示範四方諸藩，朝廷最終只設置了一個襄州兵馬府，以趙匡凝爲都帥，並全其山南東道襄、鄧、唐、隨、郢、均、房七州之地。
其餘黔中、江南西道、嶺南、福建等地，不一一而足，均根據當地形勢，拉一踩一，遏制地方強藩兼併坐大。
……
關內地區，纔是朝廷的重點。
全力打壓李茂貞。
岐、隴、秦、成四州，首先劃出秦、成二州，秦州劃歸夏綏兵馬府，由李思恭代領，成州劃給興鳳兵馬府，由滿存代領。岐、隴二州也要分做兩個兵馬府，李茂勳領隴州兵馬府都帥，李茂貞的鳳翔兵馬府便只剩下一個岐州了。
遭如此刻薄對待，李茂貞肯定會激烈抗旨，但朝廷也顧不上這許多了，他李茂貞先悍然出兵佔武功、奉天，如今又不顧朝廷勸阻攻佔鳳州，早讓雙方關係僵化，也不差這一回了。
至於此舉是否會徹底激怒李茂貞，讓他再度興兵……
等到了那一天再說……
且如此瓜分鳳翔鎮地，也就給了李思恭向鳳翔興兵的理由和動機，也多少能安撫滿存，讓他繼續困守在鳳州境內。
同時，說不定還能挑撥李茂貞、李茂勳兄弟蕭牆相鬥。
……
只剩下京畿兵馬府。
張濬、劉崇望二人猜度天子的意圖，天子應是想親自統帥。可天子已是天下兵馬大元帥，又如何自降身份，來兼領京畿兵馬府都帥一職？
二人不敢擅自做主，故而只劃出京畿兵馬府管轄區域，沒有推薦都帥人選，交由天子自己決斷。
最後闡明朝廷設立兵馬府的宗旨。
“今鯨鯢四起，樂浪玄菟之境，鋒鏑交加，君臣逋亡，人民離散，天下其苦也哉……
“茲有各道行營兵馬，委都帥一人，選任賢能，調遣軍馬，糧草轉運，民夫徵調，一應任之。惟望各懷仁德，息兵安民，奉公體國，以消萌釁，以導禎祥……
“若有妄動干戈者，不以社稷爲憂、君臣在念、百姓畏苦，必有神靈震怒，王師吊伐。蕩平妖穴，以拯阽危，亦諸公之職也……”