場景:BASE總部，BASE甘肅支部，神祕組織內部
時間:1月17日
人物:李千禧,陳精銳，神祕組織，裴元慶，渡邊博士，蘇定方，尉遲恭等
渡邊博士:(指揮助手們開啓冷凍倉)現在開始解凍。
此前身受重傷的裴元慶被運輸到BASE總部進行治療。
科研人員甲:報告，實驗體血液運行良好，器官機能良好。
科研人員乙:現在開始修復實驗體傷口與骨骼。
在醫療室外，蘇定方與尉遲恭站在透明玻璃前觀看治療裴元慶的全過程。
蘇定方:真是難以置信，裴隊員會在身受重傷的情況下被快速冰封不至喪命，至於是誰幹的，只有等他甦醒之後再詢問了。
尉遲恭:現在總部將怎樣處理甘肅支部呢?
蘇定方:支部指揮官全部殉職，也就沒有人再爲這次事件負責，但總部一定會調查清楚這次事件的真相，以及基地內部究竟發生了什麼。
尉遲恭:那拯救了我們的第三位奧特曼呢?
蘇定方:(看了一眼尉遲恭)尚不清楚他的來歷，不過從他阻止失控的戰機向人類聚居區攻擊來看，他應該不是敵人。
尉遲恭：爲什麼基地內在會出現那麼多外星生物？
蘇定方：通過殘存組織的分析，那些外星生物應該是主體的再生複製品。
在神祕組織“S”內部，13名身穿着紅色斗篷的“預言者”圍繞成圈而坐。他們中間是一個圓形裝置，外圈是十三塊藍色的能量燈，而中心則是他們守護着的神祕能量核心。
陳精銳:(走到其中一名預知者身旁，將藍色的變身器放在圓形裝置上)這次變身我的身體承受不住，能告訴我原因嗎？
預知者甲:看來是DNA的不完全性導致的錯誤。
紅衣主教:你必須適應這個力量。
陳精銳:適應?最後的結果恐怕是導致我喪命吧?
紅衣主教:記住，你本來就應該已經死亡，這個力量給了你第二次生命!
陳精銳:(轉身離開)
預知者乙:(從頭部射出麻醉光束，將陳精銳擊倒在地，又用意念力將變身器放置到陳精銳的胸膛上)
在BASE甘肅支部E12層治療室內，程知節與秦瓊分別躺在手術檯上接受醫療設備修復傷口。
程知節:(疼痛皺眉）看樣子，基地修復得一段時間了，我們這次傷亡情況怎麼樣?
秦瓊:(被器械縫合了腹部的傷口)死亡143人，傷304人，26人下落不明。
醫療機器人:請保持安靜接受手術修復。
程知節：（閉上眼睛）領導們也全犧牲了，基地也癱瘓了......
地下長廊入口，來接送八名小女孩的部隊已經到達，此次將接送她們前往BASE總部。
其中的玄女在上車前轉頭看了一眼持槍站立的李千禧，可此時的李千禧尚未完全覺醒米利尼安的力量，甚至不知道自己的變身器是假的。
玄女:(通過心電感應向李千禧傳達)去追查“女媧計劃”，去找一個名叫“女媧”的女孩，她和我們一樣。
李千禧:(心想)她在哪兒?
列車駛入地下隧道，閘門隨着列車通過而依次關閉。
陳精銳隱藏在神祕組織“S“爲他提供的特殊住所裏，隨時準備接受任務指派，他躺在牀上，回想着記憶中從土衛六空間站失事到目前發生過的所有事情，以及自己在空間站被毀後獲得艾力特奧特曼的力量而獲救的奇蹟。
陳精銳:(站在組織內一言不發)
圓形裝置中心的能量核心上懸浮着“千禧魔棒”，陳精銳看到後有些好奇。
陳精銳:這個是……
預言者甲:去BASE甘肅支部，將這個變身器交給一個叫李千禧的人，但不要泄露任何事情，去吧!
陳精銳拿出自己的變身器，按下開關的一瞬間便憑空消失，出現在BASE甘肅基地。他打開手臂上的信息終端，鏈接到BASE甘肅支部的信息庫，查找李千禧的資料，全息投影顯示出李千禧的照片。
陳精銳:預備役七中隊....
李千禧在宿舍內的電腦上搜索“女媧計劃”，但沒有任何信息顯示，緊接着電腦屏幕上顯示了“非法操作”字樣，很顯然這是個敏感詞。
宿舍內突然燈光熄滅，李千禧走到開關旁按下開關，沒有反應。
信息管理中心內，後臺人員監測到預備役七中隊李千禧的電腦在搜索“女媧計劃”。
後臺人員:（向上級報告）報告，有人非法查詢機密文件“女媧計劃”
代理指揮官:這是隻有高層才知道的機密，一個普通預備役人員怎麼會知道這個?通知特勤小隊，把這個李千禧抓過來!
李千禧意識到情況不妙，急忙打開手機上的手電筒，走向宿舍門口，但沒想到宿舍門鎖也被系統鎖死，無法打開。
走廊裏傳來一陣整齊急促的軍靴聲，李千禧慌了起來，意識到情況不對勁，匆忙在戰訓服中掏出千禧魔棒，蹲伏在辦公桌下。
“你手裏那個是假的，被人調包了都不知道?”
宿舍裏突然憑空而發出的一聲嚇得李千禧差點跳起來，匆忙把光源照向說話的地方，只見牀上躺着一個人。
李千禧:(驚魂未定)你是誰?是人是鬼!
陳精銳:(翻身起來)奧特曼還會怕鬼嗎?這也太可笑了！
此刻門外的特勤小隊已解開門鎖，慢慢打開一道門縫，向宿舍內扔進強光彈。
陳精銳:(抓住李千禧的手腕，按下變身器的按鈕)快走!
強光彈爆炸，一陣炫目的強光過後，特勤小隊衝了進來，但屋內早已不見了李千禧的蹤影。
特勤小隊隊長:搜!
陳精銳帶着李千禧瞬間移動到基地最底層，突然置身於此處的李千禧難以置信，環顧着周圍，竟忘記了詢問突然出現後帶走自己的是什麼人。
陳精銳:(從衣服口袋裏掏出千禧魔棒)你看這是什麼?
李千禧:(詫異，又掏出自己身上的千禧魔棒)你怎麼也會有這個？
陳精銳:笨蛋，你就沒發現那個是假的嗎?
李千禧:(恍然大悟)快還給我!
陳精銳:想要就來自己搶，我正好試試你的身手如何。
兩人打鬥了起來，李千禧出拳，陳精銳格擋。
陳精銳:(擋住李千禧的轉身鞭拳)轉身動作太多，防守空檔太大!
李千禧邊打，陳精銳邊退，隨後一個轉身擺腿將李千禧擊倒。
陳精銳:(將千禧魔棒扔給李千禧)弱爆了。
蹲在地上的李千禧拿着真正的千禧魔棒，和假的作對比。真正的千禧魔棒一閃一閃地發出藍色閃光。此時他彷彿靈魂出竅了一般，神情恍惚。
李千禧:(米利尼安的能力開始覺醒，預感到了什麼)400公里外，有怪獸要來了!