在泗水的南洋軍大帥馮國輝接到緊急軍報；
岸朱當地彙集數十土著部落發生叛亂，波及範圍約十幾萬人之衆，徹底阻斷了從梭羅至巖望城之間的腹地通道，影響面相當之廣。
有鑑於此
馮國輝迅速命令加強駐巖望城，及梭羅市駐軍，兩地駐軍分別增強至2100~2300餘人。
嚴守南洋軍現有駐地，防止暴動範圍蔓延，全軍第三次整編由此拉開序幕。
進入年底以後
隨着三千餘泗水城新兵和三寶壟五千餘新兵陸續完成軍訓，將有序的分批編組進入原有的八個團序列，進一步擴大和增強以火槍兵團爲作戰單位的體制。
重新整編後，
從原有的一團士兵編制600餘人，擴增了一倍多，達到一團編制1300餘人，每團編制包含四個步兵營，一個團部連，一個野戰炮連和一個騎兵排，
並增加新編第9團，泗水岸炮團，哲帕拉岸炮團和大帥府親衛兵團，總計12個團的兵力編制，全軍上下約16600餘人。
泗水城大帥府
連續九天，馮國輝召集麾下一百四十名名中高級軍官及軍政幕僚舉行最高軍政會議，就第3次全軍整編及軍隊正規化訓練，建設，被裝配發，高級軍官輪崗制度等具體事宜，一一落實安排。
在南洋軍轄下，新成立四個師級編制，三個野戰師分別是泗水師，巖望師，三寶壟師，每個師下轄三個火槍兵團，總兵力4200餘人。
另有一個海岸衛戊師，轄下泗水岸炮團，哲帕拉岸炮團及七個海岸衛戊連，總兵力約二千三百餘人。
南洋海軍暫由四艘風帆炮艦組成，全體官兵九百七十餘人，艦隊司令長官由胡華東少將擔任，
在12月底前
新兵陸續補充到位，增加編制的炮兵連，騎兵排等特種部隊完成缺額填補，武器裝備與軍裝被服俱都發放到位。
新編列的師團第一次實行高級軍官輪崗，即原有師團主官全部輪換，藉以破除“兵爲將有”的陋習，這也是新軍制改革中的一部分。
避免形成軍中嚴重的“山頭主義”，師團軍官任期滿5年，必須輪換。
例如；
泗水師由第一團，第四團和新編第九團組成，由伍思文少將擔任泗水師長，馮兆財任副師長，原長官胡老虎調任至三寶壟師。
三寶壟師由第二團，第七團和第八團組成，胡老虎少將任三寶壟師長，馮兆亮任副師長。
巖望師作爲南洋軍總預備隊，由第三團，第五團和第六團組成，麥老蔫擔任少將師長，而這支部隊是伍思文少將的老底子，其部屬衆多。
海岸衛戊師則由大帥府直轄，便捷的有線電報局聯通各地，使得軍情信息可以第一時間傳遞，極大的便捷了大帥府指揮全局的軍事部署。
在南洋軍最高軍政會議上
確立了“忠誠於南洋軍，忠誠於大帥，爲華夏民族拓展光明未來”的建軍宗旨，以此爲核心建設軍隊和民政事務。
確立了大帥府爲最高權力機構，全面指揮軍政事務，全面照搬英國的法律體系，並確立了稅收，貿易，文化教育和外交等部門職權，形成初步的國家治理結構。
從17日至25日，最高軍政會議歷時9天方纔落幕。
南洋軍從軍閥開始向國家體制進行蛻變，依然是軍事爲主，但其職能和範圍已經涉及政府事務，文化經濟發展和外交等諸多領域，變得更加龐雜起來。
“大帥，梭羅市的局面因爲土著暴動，呈現屢次鎮壓不果的反覆。當地治安形勢混亂，時常遭受小股土著武裝的侵襲，相當之令人頭疼啊！”
會議結束後
胡老虎等幾位主要將官陪着大帥回到前廳，相繼坐下後，又談到了當前局勢，眉宇間顯得相當凝重。
梭羅市是南洋軍在中爪哇腹地開闢的一個點，而不是一片，因爲梭羅市向西相鄰的沙拉迪加，克拉登全都屬於土著部族勢力範圍。
岸朱地區土著叛亂以後，從梭羅市向東至巖望城之間長約240公里的腹地內陸運輸線完全斷絕，已是不爭的事實。
梭羅市在中爪哇內陸腹地宛如一座孤島，向東，向西，向南全部都是土著勢力範圍，只有向北連接三寶壟的沿線地區，處於南洋軍的軍事掌控之下。
這種形勢，令三寶壟師長鬍老虎感到深爲憂慮，也感受到了肩膀上的重擔，所以傾向於發動大規模軍事圍剿行動。
馮國輝走到大廳的中央上座，轉身坐了下來，身後的幾位將領再下首位置，分左右也坐了下來。
親兵們迅速端來了茶水和精美茶點，給大帥和幾位少將長官擺在桌邊，然後動作迅速的悄然退下，並且屏蔽了左右。
馮國輝端起茶杯喝了一口，這幾日的最高軍政會議讓他疲憊不堪，這些高屋建瓴的會議耗費了極大精力籌備和舉行，所幸一切順利，總算一一安排了下去。
這陣子，可以稍微喘口氣了。
將茶盞放回桌子，馮國輝轉頭看向下首的幾位將領們，考慮了下說道；
“老虎在中爪哇地區面臨的局面確實嚴峻，全軍在新的整編過後，需要一個半月時間磨合，調整，並且進行實戰化的訓練。
下一步
爛陀山軍事基地將作爲常設機構，專責新兵的訓練，基層軍官專訓班的軍事和文化教育，並形成慣例。
在新的1860年度
將以每個月徵募千名新兵的規模，持續爲我南洋軍提供兵源，不斷的補充部隊損傷和缺額，形成穩定的造血機制。
全年下來，預計將提供總計12，000名後備兵力，增強和擴大野戰步兵團的實力，爲迎接戰爭做好準備。
從現在到二月中下旬
都處於熱帶雨季，岸朱土著暴亂地區山高林密，幾百年的道路年久失修，泥濘不堪，極不利於軍事行動。
官兵們出征三天兩頭的下雨，攜帶的物質極易發黴變質，身上的軍服淋溼了還沒晾乾，又下雨，很容易造成大量的非戰鬥減員。
這種情況下
宜靜不宜動，宜守不宜攻，以守好當前的地盤爲主，扼守有力地形強化要塞哨卡，防止土著暴動蔓延。
梭羅市防務不可懈怠，對不穩定的土著貴族及其部族人口，要實施嚴厲鎮壓，有殺錯沒放過，起到軍事震懾作用。
從這個月起
將有計劃的向梭羅市組織移民，以華人男性人口爲主，初期每月1200~1400人左右，至年底增長至每月兩千人規模。