是夜四更有賊一股，假裝官軍號衣號補，手持軍器洋槍，約千餘人，向太平門地道缺口衝突。經昆字、湘後、左、右各營截擊，多用火桶火蛋焚燒，人馬死者已多，約尚有六七百人騎馬衝出，向孝陵衛、定林鎮一路而逃。
伍維壽、楊鈿南、陶立忠等急率馬隊跟追；曾國荃一聞騎賊裝扮官軍逃出之信，即加派張定魁、李泰山、黃萬鵬、黃廷爵等馬隊七百騎追之，並飛諮溧水、東壩、句容各守將會合追剿。
直至十九日酋刻，伍維壽、黃萬鵬等回營面稟，追至純化鎮，生擒僞烈王李萬材，帶領前進追至湖熟鎮，見逃賊在前，當經馬隊圍住，全數斬殺，未留一人。又追至溧陽，據百姓言前路並無賊蹤。
經曾國荃親訊，李萬材供稱，城破後，僞忠王之兄巨王、幼西王、幼南王、定王、崇王、璋王等，乘夜衝出，被官軍馬隊追至湖熟橋邊，將各頭目全行殺斃，更無餘孽。
又據城內各賊供稱，首逆洪秀全實於本年五月間官軍猛攻時服毒而死，各僞官員於僞宮院內，推僞幼主重襲僞號。城破後，僞幼主積薪宮殿，舉火自焚等語。
應俟僞宮火熄，挖出洪秀全逆屍，查明自封確據，續行具奏。
至僞忠王李秀成一犯，城破受傷，匿於山內民房。
十九日，提督蕭孚泗親自搜出。並搜秦僞王次兄洪仁達。二十日，曾國荃親訊，供認不諱。應否檻送京師，抑或即在金陵正法，諮請定奪。
其餘兩廣、兩湖、江北多年悍賊，十七、十八等日，曾良佐、周光正、鄧吉山、劉泰財、聶福厚、譚信高、胡克安、朱連甲、王春華、黎冠湘，彭維祥、陳萬合、朱連泗、謝三洪、李臣虎、彭玉堂、劉金蘭等分段搜殺，三日之間，斃賊共十餘萬人，秦淮長河屍首如麻。凡僞王、僞王將、天將及大小酋目約三千餘名，死於亂軍之中者居其半，死於城河溝渠及自焚者居其半，三日夜火光不息。
至十九日尚有賊踞高屋之巔以洋槍狙擊官軍者。此馬隊窮追逸出之賊及搜剿首逆並羣賊之情形也。
現在派營救火，掩埋賊屍，安置難民婦女，料理善後事宜，百廢待興。竊念金陵一軍圍攻二載有奇，前後死於疾疫者萬餘人，死於戰陣者八九千人，令人悲涕，不堪回首。
臣等伏查洪逆倡亂粵西，於今十有五年，竊踞金陵亦十二年，流毒海內，神人共憤。我朝武功之盛超越前古，屢次削平大難，焜耀史編。
然如嘉慶川楚之役，蹂躪僅及四省，淪陷不過十餘城。康熙三藩之役，蹂躪尚止十二省，淪陷亦超三百餘城。今粵匪之變，蹂躪竟及十六省，淪陷至六百餘城之多，而其中兇酋悍黨如李開方守馮官屯，林啓榮守九江，葉芸來守安慶，皆堅忍不屈。此次金陵城破，十萬餘賊無一降者，至聚衆自焚而不悔，實爲古今罕見之巨寇。
然卒能次第蕩平，剷除元惡，臣等深維其故，蓋由我文宗顯皇帝盛德宏謨，早裕戡亂之本。宮禁雖極儉嗇，而不惜巨餉以募戰士；名器雖極慎重，而不惜破格以獎有功；廟算雖極精密，而不惜屈己以從將士之謀。
皇太后、皇上守此三者，悉循舊章而加之，去邪彌果，求賢彌廣，用能誅除僭僞，蔚成中興之業。
臣等忝竊兵符，遭逢際會，既慟我文宗不及目睹大功告成之日，又念生靈塗炭爲時過久，惟當始終慎勉，掃蕩餘匪，以蘇黎民之困，而分宵旰之憂。
所有金陵克復、全股悍賊盡數殲滅緣由，謹會同陝甘總督臣楊嶽斌、兵部侍郎臣彭玉麟、江蘇巡撫臣李鴻章、浙江巡撫臣曾國荃恭折由六百里加緊馳奏，伏乞皇太后、皇上聖鑑巡示。
兩宮太后聞金陵克復，欣喜若狂。
恭親王奕忻道：賊逆搜刮之黃金白銀，皆匿金陵城內，曾氏兄弟隻字不提，是何心思？
慈禧太后道：毋須着急，此事必有後續，金陵光復，務必褒獎，速發上諭，以慰人心。
是日，兩宮諭曰：諭內閣，本日官文、曾國藩由六百里加緊紅旗奏捷，克復江寧省城，逆首自焚，賊黨悉數殲滅，並生擒李秀成、洪仁達等逆一折，覽奏之餘，實與天下臣民同深嘉悅。
發逆洪秀全，自道光三十年倡亂以來，由廣西竄兩湖三江，並分股擾及直隸、山東等省，逆蹤幾遍天下。咸豐三年，佔踞江寧省城，僭稱僞號，東南百姓，遭其荼毒，慘不忍言，罪惡貫盈，神人共憤。
我皇考文宗顯皇帝赫然震怒，恭行天討。特命兩湖總督官文爲欽差大臣，肅清楚北上游，籌辦東征事務。復特授曾國藩爲兩江總督，並命爲欽差大臣，東征江皖賊匪，號令既專，功績日著。十一年七月，我皇考龍馭上賓，其時江浙郡縣，半就淪陷，遺詔諄切，以爲能迅殄逆氛爲憾。
朕以衝幼，寅紹丕基，祗承先烈，恭奉兩宮皇太后垂簾聽政，指示機宜，授曾國藩協辦大學士，節制四省軍務，以一事權。
該大臣自受任以來，即建議由上游分路剿辦，飭彭玉麟、楊嶽斌、曾國荃等，水陸並進，疊克沿江城隘百餘處，斬獲外援逆匪十數萬人，取其左耳，合圍江寧，斷其接濟。
本年六月十六日，曾國荃率諸將士，克復江寧，三日之內，斃賊共十餘萬人。僞王僞主將及大小酋目約三千餘名，無一得脫者。
此皆仰賴昊天眷佑，列聖垂庥，兩宮皇太后孜孜求治，識拔人材，用能內外一心，將士用命，成此大功。上慰皇考在天之靈，下孚薄海臣民之望。自維藐躬涼德，何以堪此。追思先皇未竟之志，不克親見成功，悲愴之懷，何能自己。
此次洪逆倡亂粵西，於今十有五年，竊踞江寧，亦十二年，蹂躪十數省，淪陷數百城。率能次第蕩平，殄除元惡，該領兵大臣等櫛風沐雨，艱苦備嚐，允宜特沛殊恩，用酬勞勤。
欽差大臣協辦大學士兩江總督曾國藩，自咸豐四年，在湖南首倡團練，創立舟師，屢建殊功，保全湖南郡縣，克復武漢等城，肅清江西全境，實由該大臣籌策無遺，謀勇兼備，知人善任，調度得宜。
曾國藩著加恩賞加太子太保銜，賜封一等侯爵，世襲罔替，並賞戴雙眼花翎；曾國荃賞加太子少保銜，封一等伯爵，賞戴雙眼花翎；其餘將官，李臣典、蕭孚泗、朱洪章等，皆酌情重賞；各省督撫將官，官文、李鴻章、左宗棠、楊嶽斌、彭玉麟、鮑超、馮子材等，均加厚賞。
洪秀全屍身，覓獲後銼屍梟示，仍傳首被害地方，以泄衆憤。李秀成、洪仁達二犯，即著曾國藩等派委妥員，檻送京師，訊明後盡法處治。